Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G036000.2,Sobic.007G036000.3
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PFB7
Pfam PF04043
Panther DB PTHR34838 PTHR34838:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0004857; enzyme inhibitor activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g04640.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G052200 expressed protein -
2 Sobic.009G143200 DUF630/DUF632 domains containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.001G104500 growth-regulating factor, putative, expressed -
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5 Sobic.004G317000 growth regulating factor protein, putative, expressed -
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11 Sobic.006G221300 expressed protein -
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13 Sobic.009G188500 expressed protein -
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15 Sobic.007G218100 transmembrane receptor, putative, expressed -
16 Sobic.001G054700 seed specific protein Bn15D14A, putative, expressed -
17 Sobic.005G196600 expressed protein -
18 Sobic.001G335100 OsFBX125 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.003G282500 keratin, type I cytoskeletal 9, putative, expressed -
20 Sobic.006G275500 regulator of chromosome condensation, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G036000 Sobic007G036000 Sobic004G052200 Sobic004G052200 Sobic007G036000--Sobic004G052200 Sobic009G143200 Sobic009G143200 Sobic007G036000--Sobic009G143200 Sobic001G104500 Sobic001G104500 Sobic007G036000--Sobic001G104500 Sobic004G282601 Sobic004G282601 Sobic007G036000--Sobic004G282601 Sobic004G317000 Sobic004G317000 Sobic007G036000--Sobic004G317000 Sobic010G037901 Sobic010G037901 Sobic007G036000--Sobic010G037901 Sobic009G077300 Sobic009G077300 Sobic007G036000--Sobic009G077300 Sobic005G153000 Sobic005G153000 Sobic007G036000--Sobic005G153000 Sobic002G230800 Sobic002G230800 Sobic007G036000--Sobic002G230800 Sobic006G221300 Sobic006G221300 Sobic004G052200--Sobic006G221300 Sobic004G052200--Sobic009G143200 Sobic004G052200--Sobic009G077300 Sobic001G054700 Sobic001G054700 Sobic004G052200--Sobic001G054700 Sobic006G124400 Sobic006G124400 Sobic004G052200--Sobic006G124400 Sobic007G218100 Sobic007G218100 Sobic004G052200--Sobic007G218100 Sobic006G275500 Sobic006G275500 Sobic004G052200--Sobic006G275500 Sobic004G052200--Sobic001G104500 Sobic004G052200--Sobic002G230800 Sobic005G157300 Sobic005G157300 Sobic009G143200--Sobic005G157300 Sobic009G143200--Sobic004G317000 Sobic009G143200--Sobic001G054700 Sobic003G055600 Sobic003G055600 Sobic009G143200--Sobic003G055600 Sobic009G143200--Sobic006G221300 Sobic009G143200--Sobic009G077300 Sobic004G108400 Sobic004G108400 Sobic009G143200--Sobic004G108400 Sobic009G143200--Sobic004G052200 Sobic007G187700 Sobic007G187700 Sobic009G143200--Sobic007G187700 Sobic001G104500--Sobic004G282601 Sobic001G104500--Sobic006G275500 Sobic001G104500--Sobic007G187700 Sobic001G104500--Sobic004G317000 Sobic002G256900 Sobic002G256900 Sobic001G104500--Sobic002G256900 Sobic002G168000 Sobic002G168000 Sobic001G104500--Sobic002G168000 Sobic002G055800 Sobic002G055800 Sobic001G104500--Sobic002G055800 Sobic006G016700 Sobic006G016700 Sobic001G104500--Sobic006G016700 Sobic001G104500--Sobic010G037901 Sobic004G282601--Sobic005G153000 Sobic004G282601--Sobic001G104500 Sobic004G282601--Sobic010G037901 Sobic004G282601--Sobic009G077300 Sobic009G002200 Sobic009G002200 Sobic004G282601--Sobic009G002200 Sobic004G282601--Sobic007G187700 Sobic003G290400 Sobic003G290400 Sobic004G282601--Sobic003G290400 Sobic004G282601--Sobic006G221300 Sobic005G196600 Sobic005G196600 Sobic004G282601--Sobic005G196600 Sobic004G317000--Sobic009G143200 Sobic004G317000--Sobic007G187700 Sobic004G317000--Sobic001G104500 Sobic006G196600 Sobic006G196600 Sobic004G317000--Sobic006G196600 Sobic003G282500 Sobic003G282500 Sobic004G317000--Sobic003G282500 Sobic001G238900 Sobic001G238900 Sobic004G317000--Sobic001G238900 Sobic004G317000--Sobic001G054700 Sobic002G223900 Sobic002G223900 Sobic004G317000--Sobic002G223900 Sobic004G317000--Sobic004G282601 Sobic010G037901--Sobic005G196600 Sobic006G226000 Sobic006G226000 Sobic010G037901--Sobic006G226000 Sobic003G086800 Sobic003G086800 Sobic010G037901--Sobic003G086800 Sobic009G031800 Sobic009G031800 Sobic010G037901--Sobic009G031800 Sobic009G188600 Sobic009G188600 Sobic010G037901--Sobic009G188600 Sobic010G037901--Sobic005G153000 Sobic006G135800 Sobic006G135800 Sobic010G037901--Sobic006G135800 Sobic007G160400 Sobic007G160400 Sobic010G037901--Sobic007G160400 Sobic010G037901--Sobic004G282601 Sobic009G077300--Sobic005G153000 Sobic009G077300--Sobic006G221300 Sobic009G077300--Sobic001G054700 Sobic005G163400 Sobic005G163400 Sobic009G077300--Sobic005G163400 Sobic009G077300--Sobic002G168000 Sobic002G050700 Sobic002G050700 Sobic009G077300--Sobic002G050700 Sobic009G077300--Sobic004G282601 Sobic009G077300--Sobic009G143200 Sobic009G077300--Sobic007G187700 Sobic005G153000--Sobic009G077300 Sobic005G153000--Sobic002G168000 Sobic005G153000--Sobic004G282601 Sobic005G153000--Sobic010G037901 Sobic005G153000--Sobic003G290400 Sobic005G153000--Sobic007G187700 Sobic005G153000--Sobic006G221300 Sobic003G129500 Sobic003G129500 Sobic005G153000--Sobic003G129500 Sobic005G153000--Sobic005G196600 Sobic002G230800--Sobic001G238900 Sobic010G105400 Sobic010G105400 Sobic002G230800--Sobic010G105400 Sobic002G230800--Sobic006G124400 Sobic002G230800--Sobic001G054700 Sobic003G179500 Sobic003G179500 Sobic002G230800--Sobic003G179500 Sobic009G109300 Sobic009G109300 Sobic002G230800--Sobic009G109300 Sobic002G230800--Sobic007G218100 Sobic002G246900 Sobic002G246900 Sobic002G230800--Sobic002G246900 Sobic003G244000 Sobic003G244000 Sobic002G230800--Sobic003G244000
Octagon: transcription factors


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