Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G073200.5,Sobic.008G073200.2,Sobic.008G073200.3,Sobic.008G073200.4,Sobic.008G073200.1
Synonym Sb08g006490, HB31, AtHB31
Functional annotation down-regulated TF in developmental senescence (PubMedID : 27586543)
ZF-HD protein dimerisation region containing protein, expressed
UniProt C5YTM1
Pfam PF04770
Panther DB PTHR31948 PTHR31948:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G14440 : homeobox protein 31
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g13930.1 : ZF-HD protein dimerisation region containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a013920 , Zm00025a014112 , Zm00025a032466 , Zm00025a021731 , Zm00025a029545 , Zm00025a025639 , Zm00025a047321 , Zm00025a005471 , Zm00025a046976
Brachypodium KQJ88784 , KQJ90576 , KQJ91876 , KQK00949
Barley HORVU6Hr1G069090.2 , HORVU6Hr1G069090.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G127300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
2 Sobic.001G010100 ankyrin repeat domain containing protein, expressed -
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4 Sobic.009G179800 - -
5 Sobic.005G128100 acyl carrier protein, putative, expressed -
6 Sobic.007G204400 expressed protein -
7 Sobic.003G230400 50S ribosomal protein L31, putative, expressed K02909: RP-L31, large subunit ribosomal protein L31
8 Sobic.004G072000 ribosome, putative, expressed -
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10 Sobic.003G393800 30S ribosomal protein S31, chloroplast precursor, putative, expressed K19033: PSRP4, 30S ribosomal protein S31
11 Sobic.007G205500 expressed protein -
12 Sobic.010G244600 nifU, putative, expressed -
13 Sobic.003G309700 decarboxylase, putative, expressed K01592: tyrosine decarboxylase
14 Sobic.002G299900 expressed protein -
15 Sobic.007G212400 thylakoid lumenal 19 kDa protein, chloroplast precursor, putative, expressed -
16 Sobic.003G433900 expressed protein -
17 Sobic.008G131200 DUF538 domain containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.005G116100 expressed protein -
19 Sobic.001G417200 ATP synthase B chain, chloroplast precursor, putative, expressed K02109: ATPF0B, F-type H+-transporting ATPase subunit b
20 Sobic.002G228400 gibberellin receptor GID1L2, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G073200 Sobic008G073200 Sobic006G127300 Sobic006G127300 Sobic008G073200--Sobic006G127300 Sobic001G010100 Sobic001G010100 Sobic008G073200--Sobic001G010100 Sobic003G239300 Sobic003G239300 Sobic008G073200--Sobic003G239300 Sobic009G179800 Sobic009G179800 Sobic008G073200--Sobic009G179800 Sobic005G128100 Sobic005G128100 Sobic008G073200--Sobic005G128100 Sobic007G204400 Sobic007G204400 Sobic008G073200--Sobic007G204400 Sobic003G230400 Sobic003G230400 Sobic008G073200--Sobic003G230400 Sobic004G072000 Sobic004G072000 Sobic008G073200--Sobic004G072000 Sobic009G130700 Sobic009G130700 Sobic008G073200--Sobic009G130700 Sobic006G127300--Sobic005G128100 Sobic006G127300--Sobic003G230400 Sobic007G205500 Sobic007G205500 Sobic006G127300--Sobic007G205500 Sobic006G127300--Sobic007G204400 Sobic006G127300--Sobic001G010100 Sobic001G413600 Sobic001G413600 Sobic006G127300--Sobic001G413600 Sobic006G127300--Sobic009G130700 Sobic007G004600 Sobic007G004600 Sobic006G127300--Sobic007G004600 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Octagon: transcription factors


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