Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G141400.1
Synonym Sb08g019230
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YQE5
Pfam PF05904
Panther DB PTHR33167 PTHR33167:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G13940 : Plant protein of unknown function (DUF863)
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g38870.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a004334
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G238600 chloride channel protein, putative, expressed K05016: chloride channel 7
2 Sobic.009G254200 pentatricopeptide, putative, expressed -
3 Sobic.002G343200 homeodomain-like, putative, expressed -
4 Sobic.002G386600 heat shock protein DnaJ, putative, expressed -
5 Sobic.002G428800 ubiquitin-activating enzyme, putative, expressed K03178: UBE1, ubiquitin-activating enzyme E1
6 Sobic.004G030400 expressed protein -
7 Sobic.003G134000 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.004G172500 expressed protein -
9 Sobic.004G356200 expressed protein -
10 Sobic.003G397900 dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase 63 kDasubunit precursor, putative, expressed K12667: SWP1, oligosaccharyltransferase complex subunit delta (ribophorin II)
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12 Sobic.001G051400 aminoacyl-tRNA synthetase, putative, expressed -
13 Sobic.005G132600 expressed protein -
14 Sobic.008G143100 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
15 Sobic.006G058800 tRNA synthetase class II core domain containing protein, expressed K01880: GARS, glycyl-tRNA synthetase
16 Sobic.004G340632 - -
17 Sobic.002G236500 OsPOP19 - Putative Prolyl Oligopeptidase homologue, expressed -
18 Sobic.002G239601 - -
19 Sobic.001G085800 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K14406: cleavage stimulation factor subunit 1
20 Sobic.010G244900 auxin efflux carrier, putative, expressed K17964: leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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