Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G093400.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R1V2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.009G093400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G011100 OsNucAP2 - Putative Nucleoporin Autopeptidase homologue, expressed -
2 Sobic.002G309200 FAR1 family protein, expressed -
3 Sobic.001G246500 GTPase of unknown function domain containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.004G096500 KH domain-containing protein, putative, expressed K13210: far upstream element-binding protein
5 Sobic.008G083000 ZOS12-03 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
6 Sobic.009G100050 - -
7 Sobic.002G336800 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.006G076300 RING-H2 finger protein, putative, expressed K19040: E3 ubiquitin-protein ligase ATL10/75/76/77/78
9 Sobic.007G011600 KH domain-containing protein, putative, expressed K13210: far upstream element-binding protein
10 Sobic.009G195200 ESP1, putative, expressed -
11 Sobic.003G307000 RNA recognition motif containing protein, expressed K18667: activating signal cointegrator complex subunit 2
12 Sobic.010G000100 no apical meristem protein, putative, expressed -
13 Sobic.009G074700 heat shock protein binding protein, putative, expressed K09540: SEC63, translocation protein SEC63
14 Sobic.001G303675 - -
15 Sobic.006G078600 expressed protein K11426: [histone H3]-lysine4/36 N-trimethyltransferase SMYD
16 Sobic.004G119400 ATP-binding domain-containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.001G081000 nucleotide-binding protein-like, putative, expressed K03593: mrp, ATP-binding protein involved in chromosome partitioning
18 Sobic.001G540800 DNA binding protein, putative, expressed -
19 Sobic.001G127100 alkaline phytoceramidase, putative, expressed K04711: ACER3, dihydroceramidase
20 Sobic.003G442000 IPP transferase, putative, expressed K00791: miaA, tRNA dimethylallyltransferase


Gene co-expression network
sample Sobic009G093400 Sobic009G093400 Sobic008G011100 Sobic008G011100 Sobic009G093400--Sobic008G011100 Sobic002G309200 Sobic002G309200 Sobic009G093400--Sobic002G309200 Sobic001G246500 Sobic001G246500 Sobic009G093400--Sobic001G246500 Sobic004G096500 Sobic004G096500 Sobic009G093400--Sobic004G096500 Sobic008G083000 Sobic008G083000 Sobic009G093400--Sobic008G083000 Sobic009G100050 Sobic009G100050 Sobic009G093400--Sobic009G100050 Sobic002G336800 Sobic002G336800 Sobic009G093400--Sobic002G336800 Sobic006G076300 Sobic006G076300 Sobic009G093400--Sobic006G076300 Sobic007G011600 Sobic007G011600 Sobic009G093400--Sobic007G011600 Sobic001G219600 Sobic001G219600 Sobic008G011100--Sobic001G219600 Sobic004G039200 Sobic004G039200 Sobic008G011100--Sobic004G039200 Sobic004G087600 Sobic004G087600 Sobic008G011100--Sobic004G087600 Sobic002G031400 Sobic002G031400 Sobic008G011100--Sobic002G031400 Sobic009G260500 Sobic009G260500 Sobic008G011100--Sobic009G260500 Sobic004G018300 Sobic004G018300 Sobic008G011100--Sobic004G018300 Sobic001G167200 Sobic001G167200 Sobic008G011100--Sobic001G167200 Sobic009G065100 Sobic009G065100 Sobic008G011100--Sobic009G065100 Sobic001G311500 Sobic001G311500 Sobic008G011100--Sobic001G311500 Sobic004G155600 Sobic004G155600 Sobic002G309200--Sobic004G155600 Sobic005G191900 Sobic005G191900 Sobic002G309200--Sobic005G191900 Sobic002G309200--Sobic008G011100 Sobic007G071200 Sobic007G071200 Sobic002G309200--Sobic007G071200 Sobic001G540800 Sobic001G540800 Sobic002G309200--Sobic001G540800 Sobic002G309200--Sobic004G096500 Sobic002G145800 Sobic002G145800 Sobic002G309200--Sobic002G145800 Sobic003G133900 Sobic003G133900 Sobic002G309200--Sobic003G133900 Sobic002G309200--Sobic007G011600 Sobic008G173100 Sobic008G173100 Sobic001G246500--Sobic008G173100 Sobic010G096000 Sobic010G096000 Sobic001G246500--Sobic010G096000 Sobic009G074700 Sobic009G074700 Sobic001G246500--Sobic009G074700 Sobic002G259800 Sobic002G259800 Sobic001G246500--Sobic002G259800 Sobic001G306900 Sobic001G306900 Sobic001G246500--Sobic001G306900 Sobic009G195200 Sobic009G195200 Sobic001G246500--Sobic009G195200 Sobic004G086200 Sobic004G086200 Sobic001G246500--Sobic004G086200 Sobic006G013500 Sobic006G013500 Sobic001G246500--Sobic006G013500 Sobic009G151200 Sobic009G151200 Sobic001G246500--Sobic009G151200 Sobic004G096500--Sobic007G011600 Sobic001G303675 Sobic001G303675 Sobic004G096500--Sobic001G303675 Sobic006G222300 Sobic006G222300 Sobic004G096500--Sobic006G222300 Sobic006G052300 Sobic006G052300 Sobic004G096500--Sobic006G052300 Sobic004G096500--Sobic008G011100 Sobic004G096500--Sobic002G259800 Sobic004G096500--Sobic001G306900 Sobic005G079800 Sobic005G079800 Sobic004G096500--Sobic005G079800 Sobic001G261496 Sobic001G261496 Sobic004G096500--Sobic001G261496 Sobic005G084100 Sobic005G084100 Sobic008G083000--Sobic005G084100 Sobic010G279700 Sobic010G279700 Sobic008G083000--Sobic010G279700 Sobic008G131000 Sobic008G131000 Sobic008G083000--Sobic008G131000 Sobic001G281600 Sobic001G281600 Sobic008G083000--Sobic001G281600 Sobic009G050900 Sobic009G050900 Sobic008G083000--Sobic009G050900 Sobic003G401100 Sobic003G401100 Sobic008G083000--Sobic003G401100 Sobic008G083000--Sobic008G011100 Sobic008G083000--Sobic004G018300 Sobic007G000800 Sobic007G000800 Sobic008G083000--Sobic007G000800 Sobic009G100050--Sobic001G303675 Sobic003G070100 Sobic003G070100 Sobic009G100050--Sobic003G070100 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic009G100050--Sobic001G094000 Sobic010G166000 Sobic010G166000 Sobic009G100050--Sobic010G166000 Sobic006G145000 Sobic006G145000 Sobic009G100050--Sobic006G145000 Sobic002G144966 Sobic002G144966 Sobic009G100050--Sobic002G144966 Sobic009G100050--Sobic004G096500 Sobic010G136600 Sobic010G136600 Sobic009G100050--Sobic010G136600 Sobic001G454301 Sobic001G454301 Sobic009G100050--Sobic001G454301 Sobic005G079025 Sobic005G079025 Sobic002G336800--Sobic005G079025 Sobic002G336800--Sobic008G011100 Sobic002G336800--Sobic004G087600 Sobic003G144950 Sobic003G144950 Sobic002G336800--Sobic003G144950 Sobic006G078600 Sobic006G078600 Sobic002G336800--Sobic006G078600 Sobic009G005100 Sobic009G005100 Sobic002G336800--Sobic009G005100 Sobic009G007800 Sobic009G007800 Sobic002G336800--Sobic009G007800 Sobic001G360900 Sobic001G360900 Sobic002G336800--Sobic001G360900 Sobic009G103600 Sobic009G103600 Sobic002G336800--Sobic009G103600 Sobic006G076300--Sobic002G144966 Sobic006G076300--Sobic001G303675 Sobic006G076300--Sobic009G065100 Sobic006G076300--Sobic006G013500 Sobic006G076300--Sobic002G259800 Sobic003G307000 Sobic003G307000 Sobic006G076300--Sobic003G307000 Sobic006G076300--Sobic001G454301 Sobic002G320500 Sobic002G320500 Sobic006G076300--Sobic002G320500 Sobic001G257300 Sobic001G257300 Sobic006G076300--Sobic001G257300 Sobic007G011600--Sobic004G096500 Sobic010G145800 Sobic010G145800 Sobic007G011600--Sobic010G145800 Sobic007G011600--Sobic002G145800 Sobic007G011600--Sobic006G222300 Sobic007G011600--Sobic010G279700 Sobic005G220000 Sobic005G220000 Sobic007G011600--Sobic005G220000 Sobic007G091600 Sobic007G091600 Sobic007G011600--Sobic007G091600 Sobic007G011600--Sobic005G079800 Sobic007G011600--Sobic008G011100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.