Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G190400.2,Sobic.001G190400.1
Synonym Sb01g016750
Functional annotation endonuclease/Exonuclease/phosphatase family protein, expressed
UniProt A0A1Z5S6D4 , C5WVA1
Pfam PF03372
Panther DB PTHR15822 PTHR15822:SF4
NCBI CDD KOG2756; Predicted Mg2+-dependent phosphodiesterase TTRAP
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G11800 : endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g22620.1 : endonuclease/Exonuclease/phosphatase family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a006259
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G155000 EMB1381, putative, expressed -
2 Sobic.002G031700 - -
3 Sobic.001G502600 tetratricopeptide repeat containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.010G204900 formamidopyrimidine-DNA glycosylase, putative, expressed K10563: mutM, formamidopyrimidine-DNA glycosylase
5 Sobic.002G122100 - -
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7 Sobic.001G025800 pentatricopeptide, putative, expressed -
8 Sobic.004G351800 PPR repeat containing protein, expressed -
9 Sobic.007G075800 GTPase of unknown function domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.010G100800 alpha-mannosidase 2, putative, expressed K01231: alpha-mannosidase II
11 Sobic.001G417500 expressed protein -
12 Sobic.003G267500 expressed protein -
13 Sobic.009G005400 ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed -
14 Sobic.007G097400 sin-like protein conserved region containing protein, expressed K14721: RPC5, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5
15 Sobic.001G153300 cytosolic 5-nucleotidase III, putative, expressed K01081: 5'-nucleotidase
16 Sobic.006G128400 PPR repeat containing protein, expressed -
17 Sobic.006G238600 chloride channel protein, putative, expressed K05016: chloride channel 7
18 Sobic.003G134000 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.009G105200 PPR repeat containing protein, expressed -
20 Sobic.001G495400 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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