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Transcriptome id Sobic.002G122100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QAR7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G495400 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.001G417500 expressed protein -
3 Sobic.002G031700 - -
4 Sobic.002G431400 - -
5 Sobic.010G204900 formamidopyrimidine-DNA glycosylase, putative, expressed K10563: mutM, formamidopyrimidine-DNA glycosylase
6 Sobic.004G176000 "SDG725(Ortholog in rice:Sui et al., 2012)"(PubMedID : 31659884)@histone-lysine N-methyltransferase ASHH2, putative, expressed -
7 Sobic.004G107200 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein, expressed K11855: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36/42
8 Sobic.010G100800 alpha-mannosidase 2, putative, expressed K01231: alpha-mannosidase II
9 Sobic.004G351800 PPR repeat containing protein, expressed -
10 Sobic.001G190400 endonuclease/Exonuclease/phosphatase family protein, expressed -
11 Sobic.008G017100 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, family 1, putative, expressed -
12 Sobic.003G039300 expressed protein -
13 Sobic.002G292800 MORN repeat domain containing protein, expressed -
14 Sobic.007G137800 pentatricopeptide, putative, expressed -
15 Sobic.004G119400 ATP-binding domain-containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.007G097400 sin-like protein conserved region containing protein, expressed K14721: RPC5, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5
17 Sobic.002G386600 heat shock protein DnaJ, putative, expressed -
18 Sobic.006G269800 TFIIH basal transcription factor complex p52 subunit, putative, expressed K03144: TFIIH4, GTF2H4, transcription initiation factor TFIIH subunit 4
19 Sobic.004G019500 pentatricopeptide, putative, expressed -
20 Sobic.001G261900 caffeine-induced death protein 1, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G122100 Sobic002G122100 Sobic001G495400 Sobic001G495400 Sobic002G122100--Sobic001G495400 Sobic001G417500 Sobic001G417500 Sobic002G122100--Sobic001G417500 Sobic002G031700 Sobic002G031700 Sobic002G122100--Sobic002G031700 Sobic002G431400 Sobic002G431400 Sobic002G122100--Sobic002G431400 Sobic010G204900 Sobic010G204900 Sobic002G122100--Sobic010G204900 Sobic004G176000 Sobic004G176000 Sobic002G122100--Sobic004G176000 Sobic004G107200 Sobic004G107200 Sobic002G122100--Sobic004G107200 Sobic010G100800 Sobic010G100800 Sobic002G122100--Sobic010G100800 Sobic004G351800 Sobic004G351800 Sobic002G122100--Sobic004G351800 Sobic004G097900 Sobic004G097900 Sobic001G495400--Sobic004G097900 Sobic002G386900 Sobic002G386900 Sobic001G495400--Sobic002G386900 Sobic002G292800 Sobic002G292800 Sobic001G495400--Sobic002G292800 Sobic001G032200 Sobic001G032200 Sobic001G495400--Sobic001G032200 Sobic006G170900 Sobic006G170900 Sobic001G495400--Sobic006G170900 Sobic001G495400--Sobic002G122100 Sobic004G106250 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Octagon: transcription factors


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