Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G257100.1
Synonym Sb01g023080
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WMD1
Pfam -
Panther DB PTHR33541 PTHR33541:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G13980 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g25810.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a007039 , Zm00025a017839
Brachypodium PNT78047
Barley HORVU1Hr1G015910.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G387600 expressed protein -
2 Sobic.002G356800 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
3 Sobic.002G057500 C-Myc-binding protein, putative, expressed -
4 Sobic.001G480800 Protein strubbelig-receptor family 7(PubMedID : 31721651)@STRUBBELIG-RECEPTOR FAMILY 6 precursor, putative, expressed -
5 Sobic.001G203700 formin-like protein 6 precursor, putative, expressed -
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9 Sobic.004G036800 glucan endo-1,3-beta-glucosidase precursor, putative, expressed -
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12 Sobic.003G248300 kinase, pfkB family, putative, expressed K00852: rbsK, ribokinase
13 Sobic.002G091000 - -
14 Sobic.002G238500 AGC_PVPK_like_kin82y.16 - ACG kinases include homologs to PKA, PKG and PKC, expressed -
15 Sobic.004G085700 expressed protein -
16 Sobic.010G118300 auxin-independent growth promoter protein, putative, expressed -
17 Sobic.007G129000 nucleobase-ascorbate transporter, putative, expressed -
18 Sobic.010G177100 expressed protein -
19 Sobic.002G092200 vesicle-associated membrane protein, putative, expressed K08511: vesicle-associated membrane protein 72
20 Sobic.010G265900 novel plant SNARE 11, putative, expressed K08494: novel plant SNARE


Gene co-expression network
sample Sobic001G257100 Sobic001G257100 Sobic002G387600 Sobic002G387600 Sobic001G257100--Sobic002G387600 Sobic002G356800 Sobic002G356800 Sobic001G257100--Sobic002G356800 Sobic002G057500 Sobic002G057500 Sobic001G257100--Sobic002G057500 Sobic001G480800 Sobic001G480800 Sobic001G257100--Sobic001G480800 Sobic001G203700 Sobic001G203700 Sobic001G257100--Sobic001G203700 Sobic002G184900 Sobic002G184900 Sobic001G257100--Sobic002G184900 Sobic008G027700 Sobic008G027700 Sobic001G257100--Sobic008G027700 Sobic003G041500 Sobic003G041500 Sobic001G257100--Sobic003G041500 Sobic004G036800 Sobic004G036800 Sobic001G257100--Sobic004G036800 Sobic007G084200 Sobic007G084200 Sobic002G387600--Sobic007G084200 Sobic004G274800 Sobic004G274800 Sobic002G387600--Sobic004G274800 Sobic006G267800 Sobic006G267800 Sobic002G387600--Sobic006G267800 Sobic009G079100 Sobic009G079100 Sobic002G387600--Sobic009G079100 Sobic002G387600--Sobic001G480800 Sobic010G118300 Sobic010G118300 Sobic002G387600--Sobic010G118300 Sobic001G063500 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Octagon: transcription factors


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