Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G543200.2
Synonym Sb01g050550
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5SC25
Pfam -
Panther DB PTHR31801 PTHR31801:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G47400 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g41120.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a000099
Brachypodium KQK24155
Barley -
Wheat TraesCS4D02G365100
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G382500 AARP2CN domain containing protein, expressed K14569: ribosome biogenesis protein BMS1
2 Sobic.001G097200 phosphatidylinositol kinase, putative, expressed K08873: serine/threonine-protein kinase SMG1
3 Sobic.009G184600 zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein, expressed -
4 Sobic.001G453400 CCAAT/enhancer-binding protein, putative, expressed K14832: MAK21, NOC1, ribosome biogenesis protein MAK21
5 Sobic.001G376900 utp14 protein, putative, expressed K14567: U3 small nucleolar RNA-associated protein 14
6 Sobic.004G149700 SEY1, putative, expressed -
7 Sobic.002G372500 exportin 1, putative, expressed K14288: exportin-T
8 Sobic.005G180900 DUF630/DUF632 domains containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.004G357400 beta-catenin-like protein 1, putative, expressed K12864: beta-catenin-like protein 1
10 Sobic.003G123100 expressed protein K03352: anaphase-promoting complex subunit 5
11 Sobic.005G010900 expressed protein K14311: nuclear pore complex protein Nup188
12 Sobic.007G155500 pentatricopeptide containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.002G426400 OsLonP3 - Putative Lon protease homologue, expressed K08675: PRSS15, ATP-dependent Lon protease
14 Sobic.001G335300 NOC3 - Putative nucleolar complex subunit 3, expressed K14834: nucleolar complex protein 3
15 Sobic.006G125500 expressed protein -
16 Sobic.009G246500 N-acetyltransferase 10, putative, expressed K14521: NAT10, N-acetyltransferase 10
17 Sobic.005G066900 POLD1 - Putative DNA polymerase delta catalytic subunit, expressed K02327: DNA polymerase delta subunit 1
18 Sobic.009G134900 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.010G102600 pentatricopeptide, putative, expressed -
20 Sobic.003G309050 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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