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Transcriptome id Sobic.002G248001.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W5K3
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G270100 expressed protein K14795: ribosomal RNA-processing protein 36
2 Sobic.010G050400 methyltransferase-like protein 5, putative, expressed -
3 Sobic.005G164500 expressed protein -
4 Sobic.006G269900 bystin, putative, expressed K14797: ENP1, essential nuclear protein 1
5 Sobic.005G108801 - -
6 Sobic.002G047000 YT521-B, putative, expressed -
7 Sobic.007G217100 sas10/Utp3 family protein, expressed K14767: UTP3, U3 small nucleolar RNA-associated protein 3
8 Sobic.003G077300 TP53RK-binding protein, putative, expressed K15901: CGI121, EKC/KEOPS complex subunit CGI121/TPRKB
9 Sobic.002G171300 - -
10 Sobic.008G169200 SRP40, C-terminal domain containing protein, expressed -
11 Sobic.001G431400 40S ribosomal protein S3a, putative, expressed K02984: RP-S3Ae, small subunit ribosomal protein S3Ae
12 Sobic.009G046700 ranBP1 domain containing protein, expressed K15304: Ran-binding protein 3
13 Sobic.008G160000 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed -
14 Sobic.001G251600 SET domain protein 123, putative, expressed K11426: [histone H3]-lysine4/36 N-trimethyltransferase SMYD
15 Sobic.009G249800 AARP2CN domain containing protein, expressed K14799: pre-rRNA-processing protein TSR1
16 Sobic.004G017400 expressed protein -
17 Sobic.010G031500 - -
18 Sobic.007G155700 - K14810: DDX56, ATP-dependent RNA helicase DDX56/DBP9
19 Sobic.004G157400 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K14768: UTP7, U3 small nucleolar RNA-associated protein 7
20 Sobic.003G019000 uncharacterized protein HI0077, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G248001 Sobic002G248001 Sobic002G270100 Sobic002G270100 Sobic002G248001--Sobic002G270100 Sobic010G050400 Sobic010G050400 Sobic002G248001--Sobic010G050400 Sobic005G164500 Sobic005G164500 Sobic002G248001--Sobic005G164500 Sobic006G269900 Sobic006G269900 Sobic002G248001--Sobic006G269900 Sobic005G108801 Sobic005G108801 Sobic002G248001--Sobic005G108801 Sobic002G047000 Sobic002G047000 Sobic002G248001--Sobic002G047000 Sobic007G217100 Sobic007G217100 Sobic002G248001--Sobic007G217100 Sobic003G077300 Sobic003G077300 Sobic002G248001--Sobic003G077300 Sobic002G171300 Sobic002G171300 Sobic002G248001--Sobic002G171300 Sobic009G050100 Sobic009G050100 Sobic002G270100--Sobic009G050100 Sobic003G284500 Sobic003G284500 Sobic002G270100--Sobic003G284500 Sobic002G270100--Sobic010G050400 Sobic002G270100--Sobic002G248001 Sobic010G061100 Sobic010G061100 Sobic002G270100--Sobic010G061100 Sobic001G157500 Sobic001G157500 Sobic002G270100--Sobic001G157500 Sobic002G283800 Sobic002G283800 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Octagon: transcription factors


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