Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G209400.1
Synonym Sb03g027010
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XQ79
Pfam -
Panther DB PTHR35505 PTHR35505:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G11780 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g41640.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a038454 , Zm00025a028621
Brachypodium KQK08587
Barley -
Wheat TraesCS3B02G245200 , TraesCS3A02G215200 , TraesCS3D02G217200
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G007700 expressed protein -
2 Sobic.002G412700 histone-arginine methyltransferase CARM1, putative, expressed K05931: CARM1, type I protein arginine methyltransferase
3 Sobic.006G112700 ATPOT1, putative, expressed -
4 Sobic.010G085200 mediator of RNA polymerase II transcription subunit 6, putative, expressed K15128: mediator of RNA polymerase II transcription subunit 6
5 Sobic.008G080500 expressed protein -
6 Sobic.007G097400 sin-like protein conserved region containing protein, expressed K14721: RPC5, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5
7 Sobic.004G034700 cleavage and polyadenylation specificity factor, putative, expressed K12830: SF3B3, SAP130, splicing factor 3B subunit 3
8 Sobic.008G017100 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, family 1, putative, expressed -
9 Sobic.002G356600 ZCW7, putative, expressed -
10 Sobic.006G210000 zinc finger domain, LSD1 subclass family protein, expressed -
11 Sobic.007G159200 PWWP domain containing protein, expressed -
12 Sobic.010G262100 expressed protein -
13 Sobic.001G248100 histone acetyltransferase GCN5, putative, expressed K06062: PCAF, KAT2, histone acetyltransferase
14 Sobic.006G056000 OsFBL16 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
15 Sobic.002G318800 - K14776: DDX10, ATP-dependent RNA helicase DDX10/DBP4
16 Sobic.009G142000 plus-3 domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.006G280100 SET domain containing protein, expressed -
18 Sobic.003G250900 AAA-type ATPase family protein, putative, expressed -
19 Sobic.002G309200 FAR1 family protein, expressed -
20 Sobic.006G271700 L-asparaginase precursor protein, putative, expressed K08657: taspase, threonine aspartase, 1


Gene co-expression network
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Sobic002G356600--Sobic002G412700 Sobic002G356600--Sobic008G017100 Sobic009G151800 Sobic009G151800 Sobic002G356600--Sobic009G151800
Octagon: transcription factors


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