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Transcriptome id Sobic.004G144600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YPP7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G065600 -(PubMedID : 26976818)@hydroxyacid oxidase 1, putative, expressed K11517: (S)-2-hydroxy-acid oxidase
2 Sobic.008G115900 mitochondrial carrier protein, putative, expressed -
3 Sobic.003G110800 transporter family protein, putative, expressed K08145: SLC2A8, MFS transporter, SP family, solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 8
4 Sobic.006G173600 serine racemase, putative, expressed K12235: serine racemase
5 Sobic.005G110502 - -
6 Sobic.002G098800 peroxiredoxin, putative, expressed -
7 Sobic.003G343500 NADH-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial precursor, putative, expressed K17871: NADH:ubiquinone reductase (non-electrogenic)
8 Sobic.003G262200 E3 ubiquitin ligase, putative, expressed K16276: K16276, zinc finger protein-like protein
9 Sobic.002G358500 - -
10 Sobic.006G031800 - -
11 Sobic.007G029700 BTBN17 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with non-phototropic hypocotyl 3 NPH3 and coiled-coil domains, expressed -
12 Sobic.001G003200 RNApolymerase sigma-subunit F(PubMedID : 26465154)@RNA polymerase sigma factor, putative, expressed K03086: RNA polymerase primary sigma factor
13 Sobic.010G188600 stromal membrane-associated protein, putative, expressed K12486: stromal membrane-associated protein
14 Sobic.001G484400 copper-transporting ATPase PAA1, putative, expressed K01533: P-type Cu2+ transporter
15 Sobic.005G188600 - -
16 Sobic.003G443500 cyclase/dehydrase family protein, expressed -
17 Sobic.006G092000 expressed protein K18172: COX assembly mitochondrial protein 2
18 Sobic.001G158900 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed K16189: phytochrome-interacting factor 4
19 Sobic.006G188000 expressed protein -
20 Sobic.010G153900 Spermidine synthase(PubMedID : 27325899)@Up-regulated by silicon application under drought stress(PubMedID : 24813726)@"OsSPMS1(Ortholog in rice:Tao et al., 2018)"(PubMedID : 31659935)@spermidine synthase, putative, expressed K00797: speE, SRM, spermidine synthase


Gene co-expression network
sample Sobic004G144600 Sobic004G144600 Sobic001G065600 Sobic001G065600 Sobic004G144600--Sobic001G065600 Sobic008G115900 Sobic008G115900 Sobic004G144600--Sobic008G115900 Sobic003G110800 Sobic003G110800 Sobic004G144600--Sobic003G110800 Sobic006G173600 Sobic006G173600 Sobic004G144600--Sobic006G173600 Sobic005G110502 Sobic005G110502 Sobic004G144600--Sobic005G110502 Sobic002G098800 Sobic002G098800 Sobic004G144600--Sobic002G098800 Sobic003G343500 Sobic003G343500 Sobic004G144600--Sobic003G343500 Sobic003G262200 Sobic003G262200 Sobic004G144600--Sobic003G262200 Sobic002G358500 Sobic002G358500 Sobic004G144600--Sobic002G358500 Sobic001G158900 Sobic001G158900 Sobic001G065600--Sobic001G158900 Sobic001G073900 Sobic001G073900 Sobic001G065600--Sobic001G073900 Sobic005G188600 Sobic005G188600 Sobic001G065600--Sobic005G188600 Sobic006G010900 Sobic006G010900 Sobic001G065600--Sobic006G010900 Sobic008G094000 Sobic008G094000 Sobic001G065600--Sobic008G094000 Sobic001G484400 Sobic001G484400 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Octagon: transcription factors


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