Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G225200.2
Synonym Sb05g027400
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RK10
Pfam PF07762
Panther DB PTHR33074 PTHR33074:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g39880.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a039129
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G152800 3-oxoacyl-reductase, chloroplast precursor, putative, expressed K00059: fabG, 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase
2 Sobic.002G076500 protein Kinase-associated protein phosphatase, putative, expressed K01090: protein phosphatase
3 Sobic.001G229300 expressed protein -
4 Sobic.004G172500 expressed protein -
5 Sobic.001G152700 expressed protein -
6 Sobic.006G192332 - -
7 Sobic.007G164200 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@expressed protein -
8 Sobic.009G000100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@transcriptional repressor, putative, expressed K11644: paired amphipathic helix protein Sin3a
9 Sobic.004G071500 OsFBX49 - F-box domain containing protein, expressed -
10 Sobic.008G021000 exostosin family domain containing protein, expressed -
11 Sobic.010G041100 mTERF family protein, expressed K15032: mTERF domain-containing protein, mitochondrial
12 Sobic.007G119700 OsFBX8 - F-box domain containing protein, expressed -
13 Sobic.008G019532 - -
14 Sobic.008G162300 oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family domain containing protein, expressed -
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16 Sobic.002G386600 heat shock protein DnaJ, putative, expressed -
17 Sobic.002G060700 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
18 Sobic.003G032600 - -
19 Sobic.008G152000 biotin--protein ligase, putative, expressed K03801: lipoyl(octanoyl) transferase
20 Sobic.006G012300 3-5 exonuclease domain-containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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