Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G251701.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RFI4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G06010 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g56610.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ85111 , KQJ85110
Barley -
Wheat TraesCS2B02G525700
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G309500 protein phosphatase 2C, putative, expressed K01102: pyruvate dehydrogenase phosphatase
2 Sobic.002G090700 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K14004: protein transport protein SEC13
3 Sobic.004G159000 cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial precursor, putative, expressed K00411: UQCRFS1, RIP1, ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit
4 Sobic.003G405900 mitochondrial import receptor subunit TOM20, putative, expressed -
5 Sobic.004G286100 ribosomal protein L6, putative, expressed K02933: RP-L6, MRPL6, large subunit ribosomal protein L6
6 Sobic.002G368400 mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17, putative, expressed K17795: mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM17
7 Sobic.010G042800 peptidase, T1 family, putative, expressed K02737: 20S proteasome subunit beta 5
8 Sobic.008G175100 expressed protein K17422: large subunit ribosomal protein L41
9 Sobic.006G220700 signal recognition particle 14 kDa protein, putative, expressed K03104: signal recognition particle subunit SRP14
10 Sobic.003G332401 - K07937: ADP-ribosylation factor 1/2
K07977: Arf/Sar family, other
11 Sobic.003G381000 transcriptional regulator, putative, expressed -
12 Sobic.004G164000 glycosyltransferase, putative, expressed K08238: xyloglucan 6-xylosyltransferase
13 Sobic.003G217100 Yip1 domain containing protein, expressed -
14 Sobic.002G078400 ADP-ribosylation factor, putative, expressed K07937: ADP-ribosylation factor 1/2
K07977: Arf/Sar family, other
15 Sobic.001G342200 40S ribosomal protein S15a, putative, expressed K02957: RP-S15Ae, small subunit ribosomal protein S15Ae
16 Sobic.001G526100 uncharacterized Cys-rich domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.001G392800 NADH dehydrogenase 1 alpha subcomplex subunit 5, putative, expressed K03949: NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex subunit 5
18 Sobic.008G132800 expressed protein -
19 Sobic.003G196600 expressed protein -
20 Sobic.009G112900 expressed protein K18170: LYRM7, complex III assembly factor LYRM7


Gene co-expression network
sample Sobic006G251701 Sobic006G251701 Sobic001G309500 Sobic001G309500 Sobic006G251701--Sobic001G309500 Sobic002G090700 Sobic002G090700 Sobic006G251701--Sobic002G090700 Sobic004G159000 Sobic004G159000 Sobic006G251701--Sobic004G159000 Sobic003G405900 Sobic003G405900 Sobic006G251701--Sobic003G405900 Sobic004G286100 Sobic004G286100 Sobic006G251701--Sobic004G286100 Sobic002G368400 Sobic002G368400 Sobic006G251701--Sobic002G368400 Sobic010G042800 Sobic010G042800 Sobic006G251701--Sobic010G042800 Sobic008G175100 Sobic008G175100 Sobic006G251701--Sobic008G175100 Sobic006G220700 Sobic006G220700 Sobic006G251701--Sobic006G220700 Sobic004G196300 Sobic004G196300 Sobic001G309500--Sobic004G196300 Sobic010G153100 Sobic010G153100 Sobic001G309500--Sobic010G153100 Sobic002G078400 Sobic002G078400 Sobic001G309500--Sobic002G078400 Sobic003G217100 Sobic003G217100 Sobic001G309500--Sobic003G217100 Sobic001G526100 Sobic001G526100 Sobic001G309500--Sobic001G526100 Sobic001G309500--Sobic002G090700 Sobic008G132800 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Octagon: transcription factors


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