Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G103500.3
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RA18
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cDNA sequences
Sobic.007G103500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G105700 protein binding protein, putative, expressed K19042: E3 ubiquitin-protein ligase BOI and related proteins
2 Sobic.002G043100 histone deacetylase, putative, expressed K11407: histone deacetylase 6
3 Sobic.010G094700 aberrant root formation protein 4, putative, expressed -
4 Sobic.002G405200 AMP deaminase, putative, expressed K01488: add, adenosine deaminase
5 Sobic.003G052800 RST1, putative, expressed -
6 Sobic.006G269800 TFIIH basal transcription factor complex p52 subunit, putative, expressed K03144: TFIIH4, GTF2H4, transcription initiation factor TFIIH subunit 4
7 Sobic.004G107200 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein, expressed K11855: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36/42
8 Sobic.010G016600 CAMK_CAMK_like.6 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed -
9 Sobic.001G501800 ZOS1-20 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
10 Sobic.001G451300 NUP155, putative, expressed K14312: NUP155, NUP170, nuclear pore complex protein Nup155
11 Sobic.003G217200 endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain containing protein, expressed -
12 Sobic.008G132900 expressed protein -
13 Sobic.002G372500 exportin 1, putative, expressed K14288: exportin-T
14 Sobic.002G431400 - -
15 Sobic.001G429600 HEAT repeat family protein, putative, expressed -
16 Sobic.006G080400 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase domain containing protein, expressed K11851: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30
17 Sobic.006G119400 SWIM zinc finger family protein, putative, expressed -
18 Sobic.003G309050 - -
19 Sobic.004G248600 expressed protein K15166: mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23
20 Sobic.001G542400 CCR4-Not complex component, Not1domain containing protein, expressed K12604: CNOT1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1


Gene co-expression network
sample Sobic007G103500 Sobic007G103500 Sobic002G105700 Sobic002G105700 Sobic007G103500--Sobic002G105700 Sobic002G043100 Sobic002G043100 Sobic007G103500--Sobic002G043100 Sobic010G094700 Sobic010G094700 Sobic007G103500--Sobic010G094700 Sobic002G405200 Sobic002G405200 Sobic007G103500--Sobic002G405200 Sobic003G052800 Sobic003G052800 Sobic007G103500--Sobic003G052800 Sobic006G269800 Sobic006G269800 Sobic007G103500--Sobic006G269800 Sobic004G107200 Sobic004G107200 Sobic007G103500--Sobic004G107200 Sobic010G016600 Sobic010G016600 Sobic007G103500--Sobic010G016600 Sobic001G501800 Sobic001G501800 Sobic007G103500--Sobic001G501800 Sobic004G267900 Sobic004G267900 Sobic002G105700--Sobic004G267900 Sobic004G243600 Sobic004G243600 Sobic002G105700--Sobic004G243600 Sobic002G105700--Sobic002G405200 Sobic010G057500 Sobic010G057500 Sobic002G105700--Sobic010G057500 Sobic002G374300 Sobic002G374300 Sobic002G105700--Sobic002G374300 Sobic010G027900 Sobic010G027900 Sobic002G105700--Sobic010G027900 Sobic006G019300 Sobic006G019300 Sobic002G105700--Sobic006G019300 Sobic007G018400 Sobic007G018400 Sobic002G105700--Sobic007G018400 Sobic002G105700--Sobic007G103500 Sobic002G043100--Sobic004G107200 Sobic001G451300 Sobic001G451300 Sobic002G043100--Sobic001G451300 Sobic002G043100--Sobic001G501800 Sobic002G399800 Sobic002G399800 Sobic002G043100--Sobic002G399800 Sobic010G262100 Sobic010G262100 Sobic002G043100--Sobic010G262100 Sobic002G043100--Sobic006G269800 Sobic003G309050 Sobic003G309050 Sobic002G043100--Sobic003G309050 Sobic002G425500 Sobic002G425500 Sobic002G043100--Sobic002G425500 Sobic001G393900 Sobic001G393900 Sobic002G043100--Sobic001G393900 Sobic005G191900 Sobic005G191900 Sobic010G094700--Sobic005G191900 Sobic009G109200 Sobic009G109200 Sobic010G094700--Sobic009G109200 Sobic010G279450 Sobic010G279450 Sobic010G094700--Sobic010G279450 Sobic010G079500 Sobic010G079500 Sobic010G094700--Sobic010G079500 Sobic001G529600 Sobic001G529600 Sobic010G094700--Sobic001G529600 Sobic004G096400 Sobic004G096400 Sobic010G094700--Sobic004G096400 Sobic001G311500 Sobic001G311500 Sobic010G094700--Sobic001G311500 Sobic008G132900 Sobic008G132900 Sobic010G094700--Sobic008G132900 Sobic010G094700--Sobic001G393900 Sobic001G430400 Sobic001G430400 Sobic002G405200--Sobic001G430400 Sobic006G188500 Sobic006G188500 Sobic002G405200--Sobic006G188500 Sobic008G002300 Sobic008G002300 Sobic002G405200--Sobic008G002300 Sobic002G405200--Sobic002G105700 Sobic001G178300 Sobic001G178300 Sobic002G405200--Sobic001G178300 Sobic006G088200 Sobic006G088200 Sobic002G405200--Sobic006G088200 Sobic002G405200--Sobic008G132900 Sobic002G405200--Sobic002G374300 Sobic010G089800 Sobic010G089800 Sobic002G405200--Sobic010G089800 Sobic003G052800--Sobic006G269800 Sobic002G145800 Sobic002G145800 Sobic003G052800--Sobic002G145800 Sobic002G430300 Sobic002G430300 Sobic003G052800--Sobic002G430300 Sobic002G371600 Sobic002G371600 Sobic003G052800--Sobic002G371600 Sobic002G372500 Sobic002G372500 Sobic003G052800--Sobic002G372500 Sobic001G051700 Sobic001G051700 Sobic003G052800--Sobic001G051700 Sobic003G052800--Sobic002G043100 Sobic010G174700 Sobic010G174700 Sobic003G052800--Sobic010G174700 Sobic003G217200 Sobic003G217200 Sobic003G052800--Sobic003G217200 Sobic006G269800--Sobic002G145800 Sobic006G269800--Sobic003G052800 Sobic008G147200 Sobic008G147200 Sobic006G269800--Sobic008G147200 Sobic008G017100 Sobic008G017100 Sobic006G269800--Sobic008G017100 Sobic006G269800--Sobic001G393900 Sobic006G269800--Sobic002G043100 Sobic001G417500 Sobic001G417500 Sobic006G269800--Sobic001G417500 Sobic006G269800--Sobic004G107200 Sobic006G269800--Sobic002G425500 Sobic002G431400 Sobic002G431400 Sobic004G107200--Sobic002G431400 Sobic004G107200--Sobic002G425500 Sobic006G119400 Sobic006G119400 Sobic004G107200--Sobic006G119400 Sobic003G101500 Sobic003G101500 Sobic004G107200--Sobic003G101500 Sobic004G107200--Sobic002G043100 Sobic004G107200--Sobic001G501800 Sobic001G456900 Sobic001G456900 Sobic004G107200--Sobic001G456900 Sobic001G261900 Sobic001G261900 Sobic004G107200--Sobic001G261900 Sobic004G107200--Sobic006G269800 Sobic010G016600--Sobic010G094700 Sobic003G378100 Sobic003G378100 Sobic010G016600--Sobic003G378100 Sobic002G008100 Sobic002G008100 Sobic010G016600--Sobic002G008100 Sobic010G016600--Sobic002G043100 Sobic004G318000 Sobic004G318000 Sobic010G016600--Sobic004G318000 Sobic010G016600--Sobic010G079500 Sobic007G075800 Sobic007G075800 Sobic010G016600--Sobic007G075800 Sobic004G030800 Sobic004G030800 Sobic010G016600--Sobic004G030800 Sobic010G016600--Sobic001G393900 Sobic001G501800--Sobic002G043100 Sobic001G501800--Sobic004G107200 Sobic005G200800 Sobic005G200800 Sobic001G501800--Sobic005G200800 Sobic001G501800--Sobic002G425500 Sobic003G409200 Sobic003G409200 Sobic001G501800--Sobic003G409200 Sobic001G063700 Sobic001G063700 Sobic001G501800--Sobic001G063700 Sobic001G501800--Sobic003G101500 Sobic003G360400 Sobic003G360400 Sobic001G501800--Sobic003G360400 Sobic001G346900 Sobic001G346900 Sobic001G501800--Sobic001G346900
Octagon: transcription factors


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