Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G150900.1
Synonym Sb09g021480
Functional annotation FabA-like domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6P8M7
Pfam PF07977
Panther DB PTHR30272 PTHR30272:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology K02372; 3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G10160 : Thioesterase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g36000.1 : FabA-like domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a037304
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G530800 T-complex protein, putative, expressed K09496: T-complex protein 1 subunit delta
2 Sobic.002G000300 RNA polymerase subunit, putative, expressed K03008: RPB11, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11
3 Sobic.001G382200 eukaryotic translation initiation factor 2 subunit beta, putative, expressed K03238: translation initiation factor 2 subunit 2
4 Sobic.004G208100 expressed protein -
5 Sobic.003G109200 expressed protein -
6 Sobic.009G258500 notchless protein, putative, expressed K14855: RSA4, ribosome assembly protein 4
7 Sobic.003G118400 expressed protein -
8 Sobic.006G189200 ubiquitin-conjugating enzyme, putative, expressed K10577: UBE2I, ubiquitin-conjugating enzyme E2 I
9 Sobic.006G265700 PPR repeat containing protein, expressed -
10 Sobic.001G371100 nucleolar protein 5A, putative, expressed K14564: nucleolar protein 56
11 Sobic.010G277000 exosome complex exonuclease, putative, expressed K12589: RRP42, exosome complex component RRP42
12 Sobic.007G176800 acyl carrier protein, putative, expressed -
13 Sobic.002G116500 methyltransferase, putative, expressed K00599: methyltransferase-like protein 6
14 Sobic.002G254500 oxidoreductase, putative, expressed K18160: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2
15 Sobic.009G109300 POLA4 - Putative DNA polymerase alpha complex subunit, expressed K02684: DNA primase small subunit
16 Sobic.001G026600 - -
17 Sobic.002G087000 peptidase, T1 family, putative, expressed K02739: 20S proteasome subunit beta 2
18 Sobic.010G021900 rad1, putative, expressed K02830: HRAD1, cell cycle checkpoint protein
19 Sobic.008G084100 adenylate kinase, putative, expressed K00939: adk, adenylate kinase
20 Sobic.002G303800 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic009G150900 Sobic009G150900 Sobic001G530800 Sobic001G530800 Sobic009G150900--Sobic001G530800 Sobic002G000300 Sobic002G000300 Sobic009G150900--Sobic002G000300 Sobic001G382200 Sobic001G382200 Sobic009G150900--Sobic001G382200 Sobic004G208100 Sobic004G208100 Sobic009G150900--Sobic004G208100 Sobic003G109200 Sobic003G109200 Sobic009G150900--Sobic003G109200 Sobic009G258500 Sobic009G258500 Sobic009G150900--Sobic009G258500 Sobic003G118400 Sobic003G118400 Sobic009G150900--Sobic003G118400 Sobic006G189200 Sobic006G189200 Sobic009G150900--Sobic006G189200 Sobic006G265700 Sobic006G265700 Sobic009G150900--Sobic006G265700 Sobic004G047200 Sobic004G047200 Sobic001G530800--Sobic004G047200 Sobic001G214900 Sobic001G214900 Sobic001G530800--Sobic001G214900 Sobic001G026600 Sobic001G026600 Sobic001G530800--Sobic001G026600 Sobic001G371100 Sobic001G371100 Sobic001G530800--Sobic001G371100 Sobic009G234400 Sobic009G234400 Sobic001G530800--Sobic009G234400 Sobic002G423500 Sobic002G423500 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Octagon: transcription factors


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