Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G155250.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R3T4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G002600 expressed protein -
2 Sobic.010G237900 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.003G379200 wound-responsive family protein, putative, expressed -
4 Sobic.001G119900 - K12858: DDX23, ATP-dependent RNA helicase DDX23/PRP28
5 Sobic.001G248100 histone acetyltransferase GCN5, putative, expressed K06062: PCAF, KAT2, histone acetyltransferase
6 Sobic.002G052700 cyclophilin, putative, expressed K09566: peptidyl-prolyl isomerase G (cyclophilin G)
7 Sobic.004G004900 prenyltransferase, putative, expressed K14137: protein prenyltransferase alpha subunit repeat containing protein 1
8 Sobic.002G425500 ATPOT1, putative, expressed -
9 Sobic.008G051200 chaperone protein dnaJ, putative, expressed K03686: molecular chaperone DnaJ
10 Sobic.006G270600 PSF1 - Putative GINS complex subunit, expressed K10732: GINS1, GINS complex subunit 1
11 Sobic.006G067600 histone deacetylase, putative, expressed K06067: histone deacetylase 1/2
12 Sobic.002G083900 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K12881: THOC4, THO complex subunit 4
13 Sobic.009G239200 - -
14 Sobic.001G459100 SNARE domain containing protein, putative, expressed K18211: synaptosomal-associated protein 25
15 Sobic.001G020000 metallo-beta-lactamase, putative, expressed K14402: CPSF2, cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2
16 Sobic.001G114500 ATP binding protein, putative, expressed K06883: uncharacterized protein
17 Sobic.006G200700 elongation factor Tu, putative, expressed K14416: elongation factor 1 alpha-like protein
18 Sobic.002G344000 expressed protein -
19 Sobic.003G122500 RNA binding protein, putative, expressed K12741: heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1/A3
20 Sobic.007G165900 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, family 1, putative, expressed K05610: UCHL5, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase L5


Gene co-expression network
sample Sobic009G155250 Sobic009G155250 Sobic001G002600 Sobic001G002600 Sobic009G155250--Sobic001G002600 Sobic010G237900 Sobic010G237900 Sobic009G155250--Sobic010G237900 Sobic003G379200 Sobic003G379200 Sobic009G155250--Sobic003G379200 Sobic001G119900 Sobic001G119900 Sobic009G155250--Sobic001G119900 Sobic001G248100 Sobic001G248100 Sobic009G155250--Sobic001G248100 Sobic002G052700 Sobic002G052700 Sobic009G155250--Sobic002G052700 Sobic004G004900 Sobic004G004900 Sobic009G155250--Sobic004G004900 Sobic002G425500 Sobic002G425500 Sobic009G155250--Sobic002G425500 Sobic008G051200 Sobic008G051200 Sobic009G155250--Sobic008G051200 Sobic001G002600--Sobic010G237900 Sobic004G129300 Sobic004G129300 Sobic001G002600--Sobic004G129300 Sobic010G145800 Sobic010G145800 Sobic001G002600--Sobic010G145800 Sobic004G155600 Sobic004G155600 Sobic001G002600--Sobic004G155600 Sobic006G118700 Sobic006G118700 Sobic001G002600--Sobic006G118700 Sobic007G191700 Sobic007G191700 Sobic001G002600--Sobic007G191700 Sobic006G096900 Sobic006G096900 Sobic001G002600--Sobic006G096900 Sobic006G014100 Sobic006G014100 Sobic001G002600--Sobic006G014100 Sobic003G133900 Sobic003G133900 Sobic001G002600--Sobic003G133900 Sobic010G237900--Sobic004G129300 Sobic010G237900--Sobic007G191700 Sobic010G237900--Sobic001G002600 Sobic007G084100 Sobic007G084100 Sobic010G237900--Sobic007G084100 Sobic010G237900--Sobic002G425500 Sobic010G237900--Sobic006G014100 Sobic003G121300 Sobic003G121300 Sobic010G237900--Sobic003G121300 Sobic004G156800 Sobic004G156800 Sobic010G237900--Sobic004G156800 Sobic010G237900--Sobic010G145800 Sobic006G261400 Sobic006G261400 Sobic003G379200--Sobic006G261400 Sobic009G044800 Sobic009G044800 Sobic003G379200--Sobic009G044800 Sobic006G088200 Sobic006G088200 Sobic003G379200--Sobic006G088200 Sobic003G360400 Sobic003G360400 Sobic003G379200--Sobic003G360400 Sobic008G083200 Sobic008G083200 Sobic003G379200--Sobic008G083200 Sobic010G000800 Sobic010G000800 Sobic003G379200--Sobic010G000800 Sobic001G354600 Sobic001G354600 Sobic003G379200--Sobic001G354600 Sobic003G363700 Sobic003G363700 Sobic003G379200--Sobic003G363700 Sobic006G174850 Sobic006G174850 Sobic003G379200--Sobic006G174850 Sobic003G122500 Sobic003G122500 Sobic001G119900--Sobic003G122500 Sobic010G228700 Sobic010G228700 Sobic001G119900--Sobic010G228700 Sobic004G235300 Sobic004G235300 Sobic001G119900--Sobic004G235300 Sobic001G119900--Sobic008G051200 Sobic002G083900 Sobic002G083900 Sobic001G119900--Sobic002G083900 Sobic001G119900--Sobic009G155250 Sobic010G085200 Sobic010G085200 Sobic001G119900--Sobic010G085200 Sobic001G251100 Sobic001G251100 Sobic001G119900--Sobic001G251100 Sobic001G119900--Sobic002G052700 Sobic002G412700 Sobic002G412700 Sobic001G248100--Sobic002G412700 Sobic001G248100--Sobic010G000800 Sobic007G145400 Sobic007G145400 Sobic001G248100--Sobic007G145400 Sobic005G115500 Sobic005G115500 Sobic001G248100--Sobic005G115500 Sobic010G262100 Sobic010G262100 Sobic001G248100--Sobic010G262100 Sobic001G248100--Sobic006G261400 Sobic002G160700 Sobic002G160700 Sobic001G248100--Sobic002G160700 Sobic001G248100--Sobic004G155600 Sobic003G405500 Sobic003G405500 Sobic001G248100--Sobic003G405500 Sobic002G052700--Sobic001G251100 Sobic004G357400 Sobic004G357400 Sobic002G052700--Sobic004G357400 Sobic003G042400 Sobic003G042400 Sobic002G052700--Sobic003G042400 Sobic004G321700 Sobic004G321700 Sobic002G052700--Sobic004G321700 Sobic001G393900 Sobic001G393900 Sobic002G052700--Sobic001G393900 Sobic001G003500 Sobic001G003500 Sobic002G052700--Sobic001G003500 Sobic001G052400 Sobic001G052400 Sobic002G052700--Sobic001G052400 Sobic002G052700--Sobic003G379200 Sobic008G147200 Sobic008G147200 Sobic002G052700--Sobic008G147200 Sobic003G168100 Sobic003G168100 Sobic004G004900--Sobic003G168100 Sobic006G252900 Sobic006G252900 Sobic004G004900--Sobic006G252900 Sobic004G158400 Sobic004G158400 Sobic004G004900--Sobic004G158400 Sobic005G167700 Sobic005G167700 Sobic004G004900--Sobic005G167700 Sobic004G004900--Sobic002G425500 Sobic004G131300 Sobic004G131300 Sobic004G004900--Sobic004G131300 Sobic009G132700 Sobic009G132700 Sobic004G004900--Sobic009G132700 Sobic004G140600 Sobic004G140600 Sobic004G004900--Sobic004G140600 Sobic001G433800 Sobic001G433800 Sobic004G004900--Sobic001G433800 Sobic001G020000 Sobic001G020000 Sobic002G425500--Sobic001G020000 Sobic001G155400 Sobic001G155400 Sobic002G425500--Sobic001G155400 Sobic003G188400 Sobic003G188400 Sobic002G425500--Sobic003G188400 Sobic004G107200 Sobic004G107200 Sobic002G425500--Sobic004G107200 Sobic007G183900 Sobic007G183900 Sobic002G425500--Sobic007G183900 Sobic004G185800 Sobic004G185800 Sobic002G425500--Sobic004G185800 Sobic001G227200 Sobic001G227200 Sobic002G425500--Sobic001G227200 Sobic008G002500 Sobic008G002500 Sobic002G425500--Sobic008G002500 Sobic002G425500--Sobic004G155600 Sobic004G171200 Sobic004G171200 Sobic008G051200--Sobic004G171200 Sobic008G051200--Sobic001G251100 Sobic006G125900 Sobic006G125900 Sobic008G051200--Sobic006G125900 Sobic008G051200--Sobic004G185800 Sobic001G493200 Sobic001G493200 Sobic008G051200--Sobic001G493200 Sobic001G089600 Sobic001G089600 Sobic008G051200--Sobic001G089600 Sobic001G453400 Sobic001G453400 Sobic008G051200--Sobic001G453400 Sobic008G051200--Sobic001G393900 Sobic004G030800 Sobic004G030800 Sobic008G051200--Sobic004G030800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.