Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G187900.8,Sobic.010G187900.7
Synonym Sb10g023800
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0VTR5 , A0A1W0VTT0
Pfam -
Panther DB PTHR35707 PTHR35707:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G04235 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g40590.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a051336
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS7A02G380200 , TraesCS7A02G380200 , TraesCS7A02G380200 , TraesCS7D02G376700 , TraesCS7B02G282200 , TraesCS7B02G282200
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G156200 POLE1 - Putative DNA polymerase epsilon catalytic subunit, expressed K02324: DNA polymerase epsilon subunit 1
2 Sobic.005G068800 TOPBP1A - Similar to DNA replication protein TOPBP1 from, expressed K10728: topoisomerase (DNA) II binding protein 1
3 Sobic.001G507000 expressed protein -
4 Sobic.004G095200 Peptidase family C50, putative, expressed K02365: separase
5 Sobic.009G052100 tubulin/FtsZ domain containing protein, putative, expressed K10389: tubulin gamma
6 Sobic.003G292700 kinesin motor protein-related, putative, expressed K10406: kinesin family member C2/C3
7 Sobic.007G221700 expressed protein -
8 Sobic.009G146250 - -
9 Sobic.009G225500 serine/threonine protein phosphatase 2A 59 kDa regulatory subunit Bgamma isoform, putative, expressed K11584: serine/threonine-protein phosphatase 2A regulatory subunit B'
10 Sobic.008G118100 kelch repeat protein, putative, expressed -
11 Sobic.002G351700 glucan endo-1,3-beta-glucosidase precursor, putative, expressed -
12 Sobic.002G021200 expressed protein K19001: HELLS, ATP-dependent DNA helicase
13 Sobic.005G157300 protein binding protein, putative, expressed -
14 Sobic.002G253900 growth regulator related protein, putative, expressed -
15 Sobic.009G202801 - K10406: kinesin family member C2/C3
16 Sobic.004G321400 BRUSHY 1, putative, expressed -
17 Sobic.002G095300 deoxynucleoside kinase family, putative, expressed K00893: deoxycitidine kinase
18 Sobic.003G409600 zinc finger DHHC domain-containing protein, putative, expressed K16675: palmitoyltransferase ZDHHC9/14/18
19 Sobic.006G071628 - -
20 Sobic.003G226700 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed K10393: KIF2_24, kinesin family member 2/24


Gene co-expression network
sample Sobic010G187900 Sobic010G187900 Sobic004G156200 Sobic004G156200 Sobic010G187900--Sobic004G156200 Sobic005G068800 Sobic005G068800 Sobic010G187900--Sobic005G068800 Sobic001G507000 Sobic001G507000 Sobic010G187900--Sobic001G507000 Sobic004G095200 Sobic004G095200 Sobic010G187900--Sobic004G095200 Sobic009G052100 Sobic009G052100 Sobic010G187900--Sobic009G052100 Sobic003G292700 Sobic003G292700 Sobic010G187900--Sobic003G292700 Sobic007G221700 Sobic007G221700 Sobic010G187900--Sobic007G221700 Sobic009G146250 Sobic009G146250 Sobic010G187900--Sobic009G146250 Sobic009G225500 Sobic009G225500 Sobic010G187900--Sobic009G225500 Sobic005G110535 Sobic005G110535 Sobic004G156200--Sobic005G110535 Sobic004G156200--Sobic005G068800 Sobic003G423600 Sobic003G423600 Sobic004G156200--Sobic003G423600 Sobic002G290000 Sobic002G290000 Sobic004G156200--Sobic002G290000 Sobic009G087000 Sobic009G087000 Sobic004G156200--Sobic009G087000 Sobic006G281400 Sobic006G281400 Sobic004G156200--Sobic006G281400 Sobic003G369200 Sobic003G369200 Sobic004G156200--Sobic003G369200 Sobic004G156200--Sobic009G146250 Sobic004G156200--Sobic009G052100 Sobic005G068800--Sobic001G507000 Sobic005G068800--Sobic004G156200 Sobic005G068800--Sobic004G095200 Sobic006G120600 Sobic006G120600 Sobic005G068800--Sobic006G120600 Sobic005G068800--Sobic009G146250 Sobic006G195500 Sobic006G195500 Sobic005G068800--Sobic006G195500 Sobic003G183700 Sobic003G183700 Sobic005G068800--Sobic003G183700 Sobic002G021200 Sobic002G021200 Sobic005G068800--Sobic002G021200 Sobic005G068800--Sobic009G052100 Sobic001G507000--Sobic005G068800 Sobic004G321400 Sobic004G321400 Sobic001G507000--Sobic004G321400 Sobic001G507000--Sobic003G183700 Sobic001G146900 Sobic001G146900 Sobic001G507000--Sobic001G146900 Sobic001G507000--Sobic006G120600 Sobic001G507000--Sobic004G156200 Sobic001G507000--Sobic006G195500 Sobic001G507000--Sobic004G095200 Sobic001G507000--Sobic009G087000 Sobic004G095200--Sobic004G321400 Sobic004G095200--Sobic005G110535 Sobic004G095200--Sobic004G156200 Sobic004G095200--Sobic002G290000 Sobic004G095200--Sobic005G068800 Sobic002G113400 Sobic002G113400 Sobic004G095200--Sobic002G113400 Sobic003G118100 Sobic003G118100 Sobic004G095200--Sobic003G118100 Sobic004G095200--Sobic009G087000 Sobic003G315700 Sobic003G315700 Sobic004G095200--Sobic003G315700 Sobic004G315700 Sobic004G315700 Sobic009G052100--Sobic004G315700 Sobic009G052100--Sobic004G156200 Sobic001G507200 Sobic001G507200 Sobic009G052100--Sobic001G507200 Sobic009G049200 Sobic009G049200 Sobic009G052100--Sobic009G049200 Sobic006G071628 Sobic006G071628 Sobic009G052100--Sobic006G071628 Sobic010G250800 Sobic010G250800 Sobic009G052100--Sobic010G250800 Sobic009G052100--Sobic003G315700 Sobic010G252700 Sobic010G252700 Sobic009G052100--Sobic010G252700 Sobic003G420300 Sobic003G420300 Sobic009G052100--Sobic003G420300 Sobic003G292700--Sobic003G420300 Sobic003G226700 Sobic003G226700 Sobic003G292700--Sobic003G226700 Sobic009G202801 Sobic009G202801 Sobic003G292700--Sobic009G202801 Sobic001G054700 Sobic001G054700 Sobic003G292700--Sobic001G054700 Sobic006G142500 Sobic006G142500 Sobic003G292700--Sobic006G142500 Sobic003G032200 Sobic003G032200 Sobic003G292700--Sobic003G032200 Sobic001G377700 Sobic001G377700 Sobic003G292700--Sobic001G377700 Sobic003G292700--Sobic002G021200 Sobic008G083500 Sobic008G083500 Sobic003G292700--Sobic008G083500 Sobic002G204400 Sobic002G204400 Sobic007G221700--Sobic002G204400 Sobic004G306100 Sobic004G306100 Sobic007G221700--Sobic004G306100 Sobic003G393100 Sobic003G393100 Sobic007G221700--Sobic003G393100 Sobic002G271400 Sobic002G271400 Sobic007G221700--Sobic002G271400 Sobic007G221700--Sobic002G021200 Sobic007G221700--Sobic003G315700 Sobic002G173400 Sobic002G173400 Sobic007G221700--Sobic002G173400 Sobic003G411700 Sobic003G411700 Sobic007G221700--Sobic003G411700 Sobic008G148000 Sobic008G148000 Sobic007G221700--Sobic008G148000 Sobic009G146250--Sobic004G156200 Sobic009G146250--Sobic006G195500 Sobic009G146250--Sobic002G021200 Sobic006G275500 Sobic006G275500 Sobic009G146250--Sobic006G275500 Sobic009G146250--Sobic006G120600 Sobic007G187700 Sobic007G187700 Sobic009G146250--Sobic007G187700 Sobic001G304800 Sobic001G304800 Sobic009G146250--Sobic001G304800 Sobic009G146250--Sobic005G068800 Sobic009G146250--Sobic001G377700 Sobic009G127800 Sobic009G127800 Sobic009G225500--Sobic009G127800 Sobic003G259300 Sobic003G259300 Sobic009G225500--Sobic003G259300 Sobic009G225500--Sobic006G142500 Sobic006G221300 Sobic006G221300 Sobic009G225500--Sobic006G221300 Sobic010G086000 Sobic010G086000 Sobic009G225500--Sobic010G086000 Sobic001G425700 Sobic001G425700 Sobic009G225500--Sobic001G425700 Sobic004G179800 Sobic004G179800 Sobic009G225500--Sobic004G179800 Sobic006G272800 Sobic006G272800 Sobic009G225500--Sobic006G272800 Sobic006G281900 Sobic006G281900 Sobic009G225500--Sobic006G281900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.