Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G134800.1
Synonym Sb01g011780
Functional annotation integral membrane HPP family protein, putative, expressed
UniProt C5WPK9
Pfam PF04982
Panther DB PTHR33741
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G62720 : Integral membrane HPP family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g48030.1 : integral membrane HPP family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a017108 , Zm00025a007641
Brachypodium KQK13757
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G312800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@tyrosine phosphatase family protein, putative, expressed K18045: SIW14, tyrosine-protein phosphatase SIW14
2 Sobic.002G314400 peptidase, M24 family protein, putative, expressed K01265: methionyl aminopeptidase
3 Sobic.006G101500 expressed protein -
4 Sobic.005G039700 rhoGAP domain containing protein, expressed -
5 Sobic.002G036000 -(PubMedID : 26976818)@hydroxyacid oxidase 1, putative, expressed K11517: (S)-2-hydroxy-acid oxidase
6 Sobic.003G131600 major facilitator superfamily antiporter, putative, expressed -
7 Sobic.001G134700 2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain containing protein, expressed K02639: ferredoxin
8 Sobic.001G011700 aspartokinase, chloroplast precursor, putative, expressed K00928: aspartate kinase
9 Sobic.001G102800 expressed protein -
10 Sobic.010G214100 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, chloroplast precursor, putative, expressed K00058: serA, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase / 2-oxoglutarate reductase
11 Sobic.004G331700 aspartate aminotransferase 5(PubMedID : 26465154)@-(PubMedID : 26976818)@aminotransferase, classes I and II, domain containing protein, expressed K00811: aspartate aminotransferase, chloroplastic
12 Sobic.008G116300 expressed protein -
13 Sobic.009G140300 MLO domain containing protein, putative, expressed K08472: mlo protein
14 Sobic.003G443500 cyclase/dehydrase family protein, expressed -
15 Sobic.002G102200 acetyltransferase, GNAT family, putative, expressed -
16 Sobic.006G093900 enzyme of the cupin superfamily protein, putative, expressed K06995: uncharacterized protein
17 Sobic.001G129000 DnaK family protein, putative, expressed -
18 Sobic.001G391900 nifU, putative, expressed -
19 Sobic.001G183000 peptidase M50 family protein, putative, expressed -
20 Sobic.002G183900 DUF581 domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G134800 Sobic001G134800 Sobic004G312800 Sobic004G312800 Sobic001G134800--Sobic004G312800 Sobic002G314400 Sobic002G314400 Sobic001G134800--Sobic002G314400 Sobic006G101500 Sobic006G101500 Sobic001G134800--Sobic006G101500 Sobic005G039700 Sobic005G039700 Sobic001G134800--Sobic005G039700 Sobic002G036000 Sobic002G036000 Sobic001G134800--Sobic002G036000 Sobic003G131600 Sobic003G131600 Sobic001G134800--Sobic003G131600 Sobic001G134700 Sobic001G134700 Sobic001G134800--Sobic001G134700 Sobic001G011700 Sobic001G011700 Sobic001G134800--Sobic001G011700 Sobic001G102800 Sobic001G102800 Sobic001G134800--Sobic001G102800 Sobic002G183900 Sobic002G183900 Sobic004G312800--Sobic002G183900 Sobic009G210200 Sobic009G210200 Sobic004G312800--Sobic009G210200 Sobic004G303200 Sobic004G303200 Sobic004G312800--Sobic004G303200 Sobic006G235350 Sobic006G235350 Sobic004G312800--Sobic006G235350 Sobic004G312800--Sobic005G039700 Sobic002G405100 Sobic002G405100 Sobic004G312800--Sobic002G405100 Sobic002G133900 Sobic002G133900 Sobic004G312800--Sobic002G133900 Sobic009G140300 Sobic009G140300 Sobic004G312800--Sobic009G140300 Sobic004G331700 Sobic004G331700 Sobic004G312800--Sobic004G331700 Sobic003G085100 Sobic003G085100 Sobic002G314400--Sobic003G085100 Sobic003G150800 Sobic003G150800 Sobic002G314400--Sobic003G150800 Sobic005G111550 Sobic005G111550 Sobic002G314400--Sobic005G111550 Sobic005G063000 Sobic005G063000 Sobic002G314400--Sobic005G063000 Sobic004G235600 Sobic004G235600 Sobic002G314400--Sobic004G235600 Sobic001G001300 Sobic001G001300 Sobic002G314400--Sobic001G001300 Sobic008G001900 Sobic008G001900 Sobic002G314400--Sobic008G001900 Sobic005G001700 Sobic005G001700 Sobic002G314400--Sobic005G001700 Sobic010G214100 Sobic010G214100 Sobic002G314400--Sobic010G214100 Sobic003G387100 Sobic003G387100 Sobic006G101500--Sobic003G387100 Sobic002G102200 Sobic002G102200 Sobic006G101500--Sobic002G102200 Sobic001G183000 Sobic001G183000 Sobic006G101500--Sobic001G183000 Sobic004G211600 Sobic004G211600 Sobic006G101500--Sobic004G211600 Sobic006G101500--Sobic001G134700 Sobic003G431700 Sobic003G431700 Sobic006G101500--Sobic003G431700 Sobic003G412900 Sobic003G412900 Sobic006G101500--Sobic003G412900 Sobic006G093900 Sobic006G093900 Sobic006G101500--Sobic006G093900 Sobic008G006100 Sobic008G006100 Sobic006G101500--Sobic008G006100 Sobic002G219300 Sobic002G219300 Sobic005G039700--Sobic002G219300 Sobic005G039700--Sobic004G312800 Sobic002G402700 Sobic002G402700 Sobic005G039700--Sobic002G402700 Sobic003G391600 Sobic003G391600 Sobic005G039700--Sobic003G391600 Sobic003G042900 Sobic003G042900 Sobic005G039700--Sobic003G042900 Sobic010G173400 Sobic010G173400 Sobic005G039700--Sobic010G173400 Sobic005G039700--Sobic002G314400 Sobic005G039700--Sobic002G183900 Sobic001G011400 Sobic001G011400 Sobic005G039700--Sobic001G011400 Sobic008G053200 Sobic008G053200 Sobic002G036000--Sobic008G053200 Sobic002G036000--Sobic001G102800 Sobic004G308700 Sobic004G308700 Sobic002G036000--Sobic004G308700 Sobic001G519800 Sobic001G519800 Sobic002G036000--Sobic001G519800 Sobic002G036000--Sobic003G431700 Sobic002G036000--Sobic006G101500 Sobic003G443500 Sobic003G443500 Sobic002G036000--Sobic003G443500 Sobic004G272100 Sobic004G272100 Sobic002G036000--Sobic004G272100 Sobic008G066100 Sobic008G066100 Sobic002G036000--Sobic008G066100 Sobic006G077400 Sobic006G077400 Sobic003G131600--Sobic006G077400 Sobic004G125700 Sobic004G125700 Sobic003G131600--Sobic004G125700 Sobic007G140800 Sobic007G140800 Sobic003G131600--Sobic007G140800 Sobic003G024300 Sobic003G024300 Sobic003G131600--Sobic003G024300 Sobic003G256700 Sobic003G256700 Sobic003G131600--Sobic003G256700 Sobic003G131600--Sobic001G134800 Sobic003G131600--Sobic002G036000 Sobic007G009200 Sobic007G009200 Sobic003G131600--Sobic007G009200 Sobic006G272900 Sobic006G272900 Sobic003G131600--Sobic006G272900 Sobic004G336200 Sobic004G336200 Sobic001G134700--Sobic004G336200 Sobic005G100300 Sobic005G100300 Sobic001G134700--Sobic005G100300 Sobic003G160800 Sobic003G160800 Sobic001G134700--Sobic003G160800 Sobic001G134700--Sobic008G006100 Sobic001G134700--Sobic006G101500 Sobic001G500600 Sobic001G500600 Sobic001G134700--Sobic001G500600 Sobic008G073100 Sobic008G073100 Sobic001G134700--Sobic008G073100 Sobic005G110400 Sobic005G110400 Sobic001G134700--Sobic005G110400 Sobic001G134700--Sobic003G387100 Sobic008G021300 Sobic008G021300 Sobic001G011700--Sobic008G021300 Sobic004G175500 Sobic004G175500 Sobic001G011700--Sobic004G175500 Sobic004G343300 Sobic004G343300 Sobic001G011700--Sobic004G343300 Sobic009G125400 Sobic009G125400 Sobic001G011700--Sobic009G125400 Sobic007G004800 Sobic007G004800 Sobic001G011700--Sobic007G004800 Sobic006G103400 Sobic006G103400 Sobic001G011700--Sobic006G103400 Sobic003G132100 Sobic003G132100 Sobic001G011700--Sobic003G132100 Sobic002G152700 Sobic002G152700 Sobic001G011700--Sobic002G152700 Sobic003G197400 Sobic003G197400 Sobic001G011700--Sobic003G197400 Sobic006G207800 Sobic006G207800 Sobic001G102800--Sobic006G207800 Sobic001G102800--Sobic001G519800 Sobic003G002300 Sobic003G002300 Sobic001G102800--Sobic003G002300 Sobic010G201700 Sobic010G201700 Sobic001G102800--Sobic010G201700 Sobic009G043000 Sobic009G043000 Sobic001G102800--Sobic009G043000 Sobic001G102800--Sobic004G272100 Sobic001G102800--Sobic007G009200 Sobic007G052400 Sobic007G052400 Sobic001G102800--Sobic007G052400 Sobic001G102800--Sobic003G431700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.