Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G344600.1
Synonym Sb02g036800
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XBQ5
Pfam -
Panther DB PTHR37261 PTHR37261:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G47940 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g38160.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a048436 , Zm00025a014944
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS2A02G199400 , TraesCS2A02G199400 , TraesCS2A02G199400 , TraesCS2B02G226700 , TraesCS2B02G226700 , TraesCS2B02G226700 , TraesCS2B02G226700 , TraesCS2D02G207000 , TraesCS2D02G207000 , TraesCS2D02G207000 , TraesCS2D02G207000 , TraesCS2D02G207000
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cDNA sequences
Sobic.002G344600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G020500 expressed protein -
2 Sobic.001G509500 glutamyl-tRNA synthetase, cytoplasmic, putative, expressed K01885: EARS, glutamyl-tRNA synthetase
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5 Sobic.002G396500 FAT domain-containing protein, putative, expressed K08874: transformation/transcription domain-associated protein
6 Sobic.002G029100 GYF domain containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.005G200800 homeobox domain containing protein, expressed -
8 Sobic.008G098300 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, putative, expressed K11858: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48
9 Sobic.004G105500 expressed protein -
10 Sobic.004G048800 - K12599: SKI2, antiviral helicase SKI2
11 Sobic.001G134300 - K17613: calcineurin-binding protein cabin-1
12 Sobic.001G299700 CCR4-Not complex component, Not1domain containing protein, expressed K12604: CNOT1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1
13 Sobic.010G266500 BRE, putative, expressed K12173: BRE, BRCA1-A complex subunit BRE
14 Sobic.001G313700 expressed protein -
15 Sobic.003G214600 transcriptional corepressor LEUNIG, putative, expressed -
16 Sobic.001G137000 aberrant pollen transmission 1, putative, expressed -
17 Sobic.001G453000 no apical meristem protein, putative, expressed -
18 Sobic.010G114900 expressed protein -
19 Sobic.001G008200 expressed protein K13211: GC-rich sequence DNA-binding factor
20 Sobic.002G245000 HECT-domain domain containing protein, expressed K10591: NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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