Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G120800.2,Sobic.003G120800.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6Q2S0 , A0A097PKI7 , A0A1B6Q2R0
Pfam -
Panther DB PTHR35752
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G36440 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g15790.4,LOC_Os01g15790.3 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a024047
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G123400 MYB family transcription factor, putative, expressed K09420: MYB, transcriptional activator Myb
2 Sobic.004G332400 neurochondrin family protein, putative, expressed -
3 Sobic.003G007300 KH domain containing protein, putative, expressed K18666: activating signal cointegrator complex subunit 1
4 Sobic.002G126300 expressed protein -
5 Sobic.008G002500 RCD1, putative, expressed -
6 Sobic.003G294600 Homeobox domain containing protein, expressed -
7 Sobic.008G088851 - -
8 Sobic.005G178800 OsFBX135 - F-box domain containing protein, expressed -
9 Sobic.001G046500 C-methyltransferase, putative, expressed K00559: SMT1, sterol 24-C-methyltransferase
10 Sobic.006G125500 expressed protein -
11 Sobic.006G040800 expressed protein -
12 Sobic.001G239800 3-5 exonuclease family protein, putative, expressed K12591: RRP6, exosome complex exonuclease RRP6
13 Sobic.006G049600 methyltransferase domain containing protein, expressed -
14 Sobic.010G080700 DNA-directed RNA polymerase subunit, putative, expressed K03021: RPC2, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2
15 Sobic.009G088000 expressed protein -
16 Sobic.006G049900 MYB family transcription factor, putative, expressed K09522: DnaJ homolog subfamily C member 2
17 Sobic.003G039000 GPI transamidase component Gpi16 subunit family protein, putative, expressed K05292: GPI-anchor transamidase subunit T
18 Sobic.002G137200 ZOS9-21 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
19 Sobic.004G010500 OsFBX52 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.003G123100 expressed protein K03352: anaphase-promoting complex subunit 5


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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