Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G040500.1
Synonym Sb04g003500
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XUN3
Pfam -
Panther DB PTHR11915 PTHR11915:SF65
NCBI CDD KOG4674; Uncharacterized conserved coiled-coil protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G31570 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g05490.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a018994
Brachypodium KQJ93309 , KQJ93310 , KQJ93311
Barley HORVU6Hr1G021550.5 , HORVU6Hr1G021550.3 , HORVU6Hr1G021550.1 , HORVU6Hr1G021550.7 , HORVU6Hr1G021550.6 , HORVU6Hr1G021550.4 , HORVU6Hr1G021550.2
Wheat TraesCS6B02G146700 , TraesCS6B02G146600 , TraesCS6D02G108500 , TraesCS6A02G118400 , TraesCS6D02G108600 , TraesCS6A02G118500
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G092600 ubiquitin-protein ligase 1, putative, expressed K10592: HUWE1, MULE, E3 ubiquitin-protein ligase HUWE1
2 Sobic.002G147600 ubiquitin-protein ligase 1, putative, expressed K10592: HUWE1, MULE, E3 ubiquitin-protein ligase HUWE1
3 Sobic.002G335600 eukaryotic translation initiation factor 4G, putative, expressed K03260: translation initiation factor 4G
4 Sobic.001G493700 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase domain containing protein, expressed -
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6 Sobic.003G233400 expressed protein -
7 Sobic.004G023100 protein binding protein, putative, expressed -
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9 Sobic.003G171400 HEAT repeat family protein, putative, expressed -
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11 Sobic.007G098500 BIG, putative, expressed K10691: UBR4, E3 ubiquitin-protein ligase UBR4
12 Sobic.008G098900 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, putative, expressed K11838: USP7, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7
13 Sobic.003G170700 expressed protein -
14 Sobic.007G133700 expressed protein -
15 Sobic.006G265200 zinc finger, RING-type, putative, expressed K17592: sacsin
16 Sobic.005G162500 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, putative, expressed K11838: USP7, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7
17 Sobic.005G034700 PHD-finger family protein, expressed -
18 Sobic.002G179400 DNA binding protein, putative, expressed -
19 Sobic.002G429300 importin subunit beta, putative, expressed -
20 Sobic.001G263600 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, putative, expressed K11835: USP4_11, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4/11


Gene co-expression network
sample Sobic004G040500 Sobic004G040500 Sobic008G092600 Sobic008G092600 Sobic004G040500--Sobic008G092600 Sobic002G147600 Sobic002G147600 Sobic004G040500--Sobic002G147600 Sobic002G335600 Sobic002G335600 Sobic004G040500--Sobic002G335600 Sobic001G493700 Sobic001G493700 Sobic004G040500--Sobic001G493700 Sobic003G072200 Sobic003G072200 Sobic004G040500--Sobic003G072200 Sobic003G233400 Sobic003G233400 Sobic004G040500--Sobic003G233400 Sobic004G023100 Sobic004G023100 Sobic004G040500--Sobic004G023100 Sobic001G287500 Sobic001G287500 Sobic004G040500--Sobic001G287500 Sobic003G171400 Sobic003G171400 Sobic004G040500--Sobic003G171400 Sobic007G098500 Sobic007G098500 Sobic008G092600--Sobic007G098500 Sobic008G092600--Sobic002G147600 Sobic001G137000 Sobic001G137000 Sobic008G092600--Sobic001G137000 Sobic008G092600--Sobic004G040500 Sobic008G092600--Sobic003G072200 Sobic008G098900 Sobic008G098900 Sobic008G092600--Sobic008G098900 Sobic008G085300 Sobic008G085300 Sobic008G092600--Sobic008G085300 Sobic008G092600--Sobic003G233400 Sobic001G117200 Sobic001G117200 Sobic008G092600--Sobic001G117200 Sobic002G147600--Sobic008G092600 Sobic002G147600--Sobic008G098900 Sobic002G147600--Sobic004G040500 Sobic002G147600--Sobic008G085300 Sobic002G146300 Sobic002G146300 Sobic002G147600--Sobic002G146300 Sobic002G147600--Sobic002G335600 Sobic007G133700 Sobic007G133700 Sobic002G147600--Sobic007G133700 Sobic003G205200 Sobic003G205200 Sobic002G147600--Sobic003G205200 Sobic001G370900 Sobic001G370900 Sobic002G147600--Sobic001G370900 Sobic006G184900 Sobic006G184900 Sobic002G335600--Sobic006G184900 Sobic005G162500 Sobic005G162500 Sobic002G335600--Sobic005G162500 Sobic006G032300 Sobic006G032300 Sobic002G335600--Sobic006G032300 Sobic009G131300 Sobic009G131300 Sobic002G335600--Sobic009G131300 Sobic002G429300 Sobic002G429300 Sobic002G335600--Sobic002G429300 Sobic002G335600--Sobic001G493700 Sobic008G088872 Sobic008G088872 Sobic002G335600--Sobic008G088872 Sobic002G335600--Sobic004G040500 Sobic004G053500 Sobic004G053500 Sobic002G335600--Sobic004G053500 Sobic002G179400 Sobic002G179400 Sobic001G493700--Sobic002G179400 Sobic001G493700--Sobic005G162500 Sobic001G493700--Sobic006G184900 Sobic002G133300 Sobic002G133300 Sobic001G493700--Sobic002G133300 Sobic001G493700--Sobic009G131300 Sobic001G493700--Sobic002G429300 Sobic002G042600 Sobic002G042600 Sobic001G493700--Sobic002G042600 Sobic001G493700--Sobic002G335600 Sobic006G088200 Sobic006G088200 Sobic001G493700--Sobic006G088200 Sobic002G397500 Sobic002G397500 Sobic003G072200--Sobic002G397500 Sobic003G072200--Sobic007G098500 Sobic007G062800 Sobic007G062800 Sobic003G072200--Sobic007G062800 Sobic003G072200--Sobic003G233400 Sobic009G084900 Sobic009G084900 Sobic003G072200--Sobic009G084900 Sobic003G072200--Sobic008G098900 Sobic005G112300 Sobic005G112300 Sobic003G072200--Sobic005G112300 Sobic001G347500 Sobic001G347500 Sobic003G072200--Sobic001G347500 Sobic003G072200--Sobic002G133300 Sobic003G233400--Sobic001G287500 Sobic003G233400--Sobic003G072200 Sobic003G233400--Sobic007G098500 Sobic003G233400--Sobic001G137000 Sobic003G312100 Sobic003G312100 Sobic003G233400--Sobic003G312100 Sobic003G233400--Sobic008G092600 Sobic002G396500 Sobic002G396500 Sobic003G233400--Sobic002G396500 Sobic003G233400--Sobic002G179400 Sobic004G051200 Sobic004G051200 Sobic003G233400--Sobic004G051200 Sobic001G542500 Sobic001G542500 Sobic004G023100--Sobic001G542500 Sobic004G023100--Sobic008G085300 Sobic004G023100--Sobic002G397500 Sobic004G023100--Sobic004G040500 Sobic004G291900 Sobic004G291900 Sobic004G023100--Sobic004G291900 Sobic009G109200 Sobic009G109200 Sobic004G023100--Sobic009G109200 Sobic004G023100--Sobic001G287500 Sobic001G002000 Sobic001G002000 Sobic004G023100--Sobic001G002000 Sobic010G223100 Sobic010G223100 Sobic004G023100--Sobic010G223100 Sobic001G287500--Sobic003G233400 Sobic001G287500--Sobic003G072200 Sobic001G287500--Sobic007G098500 Sobic001G287500--Sobic004G051200 Sobic001G287500--Sobic008G092600 Sobic001G287500--Sobic001G347500 Sobic001G426600 Sobic001G426600 Sobic001G287500--Sobic001G426600 Sobic001G287500--Sobic004G040500 Sobic004G204100 Sobic004G204100 Sobic001G287500--Sobic004G204100 Sobic003G171400--Sobic004G040500 Sobic003G221400 Sobic003G221400 Sobic003G171400--Sobic003G221400 Sobic003G171400--Sobic002G147600 Sobic001G255800 Sobic001G255800 Sobic003G171400--Sobic001G255800 Sobic002G401500 Sobic002G401500 Sobic003G171400--Sobic002G401500 Sobic003G171400--Sobic002G179400 Sobic003G171400--Sobic001G493700 Sobic003G171400--Sobic002G335600 Sobic003G171400--Sobic008G085300
Octagon: transcription factors


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