Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G356000.1
Synonym Sb04g038250
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XWQ3
Pfam -
Panther DB PTHR34033 PTHR34033:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology K19022; AP-5 complex subunit beta-1
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G19870 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g58250.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a022666
Brachypodium KQK02119
Barley HORVU0Hr1G017800.8 , HORVU0Hr1G017800.6 , HORVU0Hr1G017800.7 , HORVU0Hr1G017800.4 , HORVU0Hr1G017800.5 , HORVU0Hr1G017800.2 , HORVU0Hr1G017800.3 , HORVU0Hr1G017800.1
Wheat TraesCS6A02G414500 , TraesCS6D02G399800 , TraesCS6A02G414500
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G111800 expressed protein K14827: IPI1, pre-rRNA-processing protein IPI1
2 Sobic.004G010200 expressed protein -
3 Sobic.005G020000 pentatricopeptide, putative, expressed -
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16 Sobic.004G315500 RFC5 - Putative clamp loader of PCNA, replication factor C subunit 5, expressed K10756: replication factor C subunit 3/5
17 Sobic.001G241300 expressed protein -
18 Sobic.010G027900 - -
19 Sobic.010G174700 expressed protein -
20 Sobic.002G127200 CRAL/TRIO domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G356000 Sobic004G356000 Sobic006G111800 Sobic006G111800 Sobic004G356000--Sobic006G111800 Sobic004G010200 Sobic004G010200 Sobic004G356000--Sobic004G010200 Sobic005G020000 Sobic005G020000 Sobic004G356000--Sobic005G020000 Sobic003G334200 Sobic003G334200 Sobic004G356000--Sobic003G334200 Sobic009G184600 Sobic009G184600 Sobic004G356000--Sobic009G184600 Sobic007G056200 Sobic007G056200 Sobic004G356000--Sobic007G056200 Sobic001G283300 Sobic001G283300 Sobic004G356000--Sobic001G283300 Sobic006G178100 Sobic006G178100 Sobic004G356000--Sobic006G178100 Sobic002G372500 Sobic002G372500 Sobic004G356000--Sobic002G372500 Sobic006G111800--Sobic004G356000 Sobic010G249900 Sobic010G249900 Sobic006G111800--Sobic010G249900 Sobic009G118200 Sobic009G118200 Sobic006G111800--Sobic009G118200 Sobic006G138600 Sobic006G138600 Sobic006G111800--Sobic006G138600 Sobic001G408500 Sobic001G408500 Sobic006G111800--Sobic001G408500 Sobic007G016400 Sobic007G016400 Sobic006G111800--Sobic007G016400 Sobic003G398500 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Octagon: transcription factors


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