Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G001300.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Y2M6
Pfam PF01063
Panther DB PTHR11825 PTHR11825:SF24
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008152; metabolic process GO:0003824catalytic activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G54970 : D-aminoacid aminotransferase-like PLP-dependent enzymes superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g15360.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a033258
Brachypodium KQJ93561
Barley HORVU5Hr1G048930.1 , HORVU5Hr1G048930.4 , HORVU5Hr1G048910.1 , HORVU5Hr1G048910.2
Wheat TraesCS5B02G154500 , TraesCS5B02G154500 , TraesCS5A02G156300 , TraesCS5A02G156300 , TraesCS5D02G161600 , TraesCS5D02G161600
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G326300 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
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9 Sobic.002G278000 endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein, putative, expressed K10772: AP endonuclease 2
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12 Sobic.007G076700 coproporphyrinogen III oxidase, chloroplast precursor, putative, expressed K00228: CPOX, coproporphyrinogen III oxidase
13 Sobic.005G110523 - -
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17 Sobic.002G336800 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
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20 Sobic.010G113900 Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G001300 Sobic005G001300 Sobic001G326300 Sobic001G326300 Sobic005G001300--Sobic001G326300 Sobic008G081600 Sobic008G081600 Sobic005G001300--Sobic008G081600 Sobic008G152900 Sobic008G152900 Sobic005G001300--Sobic008G152900 Sobic004G094500 Sobic004G094500 Sobic005G001300--Sobic004G094500 Sobic006G078600 Sobic006G078600 Sobic005G001300--Sobic006G078600 Sobic005G078950 Sobic005G078950 Sobic005G001300--Sobic005G078950 Sobic002G072000 Sobic002G072000 Sobic005G001300--Sobic002G072000 Sobic001G464200 Sobic001G464200 Sobic005G001300--Sobic001G464200 Sobic002G278000 Sobic002G278000 Sobic005G001300--Sobic002G278000 Sobic004G019500 Sobic004G019500 Sobic001G326300--Sobic004G019500 Sobic001G379200 Sobic001G379200 Sobic001G326300--Sobic001G379200 Sobic001G022500 Sobic001G022500 Sobic001G326300--Sobic001G022500 Sobic004G351800 Sobic004G351800 Sobic001G326300--Sobic004G351800 Sobic002G055300 Sobic002G055300 Sobic001G326300--Sobic002G055300 Sobic004G144400 Sobic004G144400 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Octagon: transcription factors


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