Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G144201.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RIP7
Pfam PF06814
Panther DB PTHR21229 PTHR21229:SF28
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016021; integral component of membrane


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G01070 : Lung seven transmembrane receptor family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g34360.1 : lung seven transmembrane domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a015723
Brachypodium KQJ88285
Barley HORVU4Hr1G038270.8 , HORVU4Hr1G038270.9 , HORVU4Hr1G038270.2 , HORVU4Hr1G038270.3 , HORVU4Hr1G038270.1 , HORVU4Hr1G038270.6 , HORVU4Hr1G038270.7 , HORVU4Hr1G038270.4 , HORVU4Hr1G038270.5
Wheat TraesCS4D02G160200 , TraesCS4B02G154100 , TraesCS4A02G159500
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G085700 exocyst complex component 5, putative, expressed -
2 Sobic.001G358500 GA20734-PA, putative, expressed -
3 Sobic.001G237600 transcription factor Dp, putative, expressed K04683: transcription factor Dp-1
4 Sobic.004G094700 ATP synthase, putative, expressed K02147: ATPeV1B, V-type H+-transporting ATPase subunit B
5 Sobic.002G199400 growth regulator related protein, putative, expressed -
6 Sobic.003G132000 proteasome subunit, putative, expressed K12176: COPS2, CSN2, COP9 signalosome complex subunit 2
7 Sobic.005G115500 bifunctional dihydrofolate reductase-thymidylate synthase, putative, expressed K13998: dihydrofolate reductase / thymidylate synthase
8 Sobic.003G363700 OsFBL5 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
9 Sobic.009G089700 ras-related protein, putative, expressed K07904: Ras-related protein Rab-11A
10 Sobic.001G469200 proteasome subunit, putative, expressed K12178: COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4
11 Sobic.010G192600 tubulin binding cofactor C, putative, expressed K16810: TBCC domain-containing protein 1
12 Sobic.009G207200 ER lumen protein retaining receptor, putative, expressed K10949: ER lumen protein retaining receptor
13 Sobic.003G182300 zinc finger family protein, putative, expressed K16284: E3 ubiquitin-protein ligase SIS3
14 Sobic.001G428800 vacuolar sorting protein, putative, expressed -
15 Sobic.002G185900 zinc finger protein-related, putative, expressed -
16 Sobic.002G020700 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K14018: PLAA, DOA1, phospholipase A-2-activating protein
17 Sobic.001G449900 conserved oligomeric complex COG6 family protein, expressed -
18 Sobic.006G039400 cation efflux family protein, putative, expressed K14696: SLC30A9, solute carrier family 30 (zinc transporter), member 9
19 Sobic.001G049400 OsPP2Ac-2 - Phosphatase 2A isoform 2 belonging to family 2, expressed K04382: serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit
20 Sobic.001G151600 OsRhmbd9 - Putative Rhomboid homologue, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G144201 Sobic005G144201 Sobic008G085700 Sobic008G085700 Sobic005G144201--Sobic008G085700 Sobic001G358500 Sobic001G358500 Sobic005G144201--Sobic001G358500 Sobic001G237600 Sobic001G237600 Sobic005G144201--Sobic001G237600 Sobic004G094700 Sobic004G094700 Sobic005G144201--Sobic004G094700 Sobic002G199400 Sobic002G199400 Sobic005G144201--Sobic002G199400 Sobic003G132000 Sobic003G132000 Sobic005G144201--Sobic003G132000 Sobic005G115500 Sobic005G115500 Sobic005G144201--Sobic005G115500 Sobic003G363700 Sobic003G363700 Sobic005G144201--Sobic003G363700 Sobic009G089700 Sobic009G089700 Sobic005G144201--Sobic009G089700 Sobic002G020700 Sobic002G020700 Sobic008G085700--Sobic002G020700 Sobic001G449900 Sobic001G449900 Sobic008G085700--Sobic001G449900 Sobic002G070600 Sobic002G070600 Sobic008G085700--Sobic002G070600 Sobic010G020400 Sobic010G020400 Sobic008G085700--Sobic010G020400 Sobic008G055900 Sobic008G055900 Sobic008G085700--Sobic008G055900 Sobic005G110499 Sobic005G110499 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Octagon: transcription factors


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