Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G038100.2,Sobic.006G038100.3,Sobic.006G038100.1
Synonym Sb06g006100
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YDS2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g36000.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a012064
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS3B02G476500
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.006G038100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G070100 expressed protein -
2 Sobic.009G100050 - -
3 Sobic.010G166000 ESP1, putative, expressed -
4 Sobic.010G129200 - -
5 Sobic.008G152900 MATH domain containing protein, expressed -
6 Sobic.009G247400 PX domain containing protein, putative, expressed K17925: sorting nexin-13
7 Sobic.009G251200 expressed protein -
8 Sobic.002G396000 XPA-binding protein 2, putative, expressed K12867: SYF1, pre-mRNA-splicing factor SYF1
9 Sobic.008G149800 histone acetyltransferase HAC5, putative, expressed K04498: EP300, CREBBP, E1A/CREB-binding protein
10 Sobic.002G158700 TATA binding protein-associated factor, putative, expressed K03131: transcription initiation factor TFIID subunit 6
11 Sobic.005G013200 BAH domain containing protein, expressed -
12 Sobic.010G039900 OsFBDUF30 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
13 Sobic.001G167200 DNA-directed polymerase, putative, expressed K03511: DNA polymerase kappa
14 Sobic.006G078600 expressed protein K11426: [histone H3]-lysine4/36 N-trimethyltransferase SMYD
15 Sobic.001G464200 flap endonuclease, putative, expressed K10846: ERCC5, XPG, DNA excision repair protein ERCC-5
16 Sobic.007G061700 vacuolar protein sorting-associated protein 18, putative, expressed -
17 Sobic.004G223600 transcription factor-related, putative, expressed K15199: general transcription factor 3C polypeptide 1
18 Sobic.002G278000 endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein, putative, expressed K10772: AP endonuclease 2
19 Sobic.010G000100 no apical meristem protein, putative, expressed -
20 Sobic.002G103600 glycosyl transferase, group 1 domain containing protein, expressed K03857: PIGA, phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit A


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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