Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G029200.1
Synonym Sb07g002540
Functional annotation myosin heavy chain-related, putative, expressed
UniProt C5YMX4
Pfam -
Panther DB PTHR33883 PTHR33883:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G34730 : myosin heavy chain-related
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g04810.1 : myosin heavy chain-related, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a040394
Brachypodium -
Barley HORVU3Hr1G032920.8 , HORVU3Hr1G032920.7 , HORVU3Hr1G032920.6 , HORVU3Hr1G032920.5 , HORVU3Hr1G032920.4 , HORVU3Hr1G032920.3 , HORVU3Hr1G032920.2 , HORVU3Hr1G032920.1
Wheat TraesCS3D02G170500 , TraesCS3A02G163700
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.007G029200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G191900 transporter family protein, putative, expressed -
2 Sobic.009G142000 plus-3 domain containing protein, putative, expressed -
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16 Sobic.008G132000 RGH1A, putative, expressed -
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19 Sobic.006G040800 expressed protein -
20 Sobic.006G210000 zinc finger domain, LSD1 subclass family protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G029200 Sobic007G029200 Sobic005G191900 Sobic005G191900 Sobic007G029200--Sobic005G191900 Sobic009G142000 Sobic009G142000 Sobic007G029200--Sobic009G142000 Sobic006G215050 Sobic006G215050 Sobic007G029200--Sobic006G215050 Sobic001G167200 Sobic001G167200 Sobic007G029200--Sobic001G167200 Sobic004G085000 Sobic004G085000 Sobic007G029200--Sobic004G085000 Sobic008G002500 Sobic008G002500 Sobic007G029200--Sobic008G002500 Sobic001G134300 Sobic001G134300 Sobic007G029200--Sobic001G134300 Sobic002G317200 Sobic002G317200 Sobic007G029200--Sobic002G317200 Sobic001G352900 Sobic001G352900 Sobic007G029200--Sobic001G352900 Sobic001G311500 Sobic001G311500 Sobic005G191900--Sobic001G311500 Sobic001G363500 Sobic001G363500 Sobic005G191900--Sobic001G363500 Sobic010G094700 Sobic010G094700 Sobic005G191900--Sobic010G094700 Sobic009G247400 Sobic009G247400 Sobic005G191900--Sobic009G247400 Sobic010G112100 Sobic010G112100 Sobic005G191900--Sobic010G112100 Sobic007G157000 Sobic007G157000 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Octagon: transcription factors


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