Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G338800.1
Synonym Sb01g032593
Functional annotation DEK C terminal domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6QMK1
Pfam PF08766
Panther DB PTHR13468 PTHR13468:SF7
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G55660 : DEK domain-containing chromatin associated protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g29960.1 : DEK C terminal domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a002856
Brachypodium KQK21296
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G127400 glycosyl hydrolase family 10 protein, putative, expressed -
2 Sobic.003G294600 Homeobox domain containing protein, expressed -
3 Sobic.009G088000 expressed protein -
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6 Sobic.009G142000 plus-3 domain containing protein, putative, expressed -
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9 Sobic.006G056000 OsFBL16 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
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12 Sobic.001G518400 EF hand family protein, putative, expressed -
13 Sobic.003G435500 expressed protein -
14 Sobic.001G170100 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed -
15 Sobic.006G215050 - -
16 Sobic.001G143600 pattern formation protein EMB30, putative, expressed K18443: golgi-specific brefeldin A-resistance guanine nucleotide exchange factor 1
17 Sobic.003G267800 ranBP1 domain containing protein, expressed K15304: Ran-binding protein 3
18 Sobic.001G138400 crooked neck, putative, expressed K12869: CRN, CRNKL1, CLF1, crooked neck
19 Sobic.010G125200 expressed protein K15425: serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2
20 Sobic.002G076000 transporter-related, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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