Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G384000.1,Sobic.001G384000.2
Synonym Sb01g036410
Functional annotation expressed protein
UniProt C5X1M8 , C5X1N5
Pfam -
Panther DB PTHR31008 PTHR31008:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G14172 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g21270.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a052449
Brachypodium KQK21852 , KQK21851
Barley -
Wheat TraesCS4D02G174600 , TraesCS4D02G174600 , TraesCS4D02G174600 , TraesCS4B02G172600 , TraesCS4B02G172600 , TraesCS4B02G172600 , TraesCS4A02G132000 , TraesCS4A02G132000 , TraesCS4A02G132000 , TraesCS4A02G132000
Populus PNS90815 , PNS90817 , PNS90816 , PNS90819 , PNS90818


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G200900 SCC3, putative, expressed K06671: STAG1_2, SCC3, cohesin complex subunit SA-1/2
2 Sobic.001G196500 plus-3 domain containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.006G138000 expressed protein -
4 Sobic.007G168300 UDP-N-acetylglucosamine--peptide N-acetylglucosaminyltransferase SPINDLY, putative, expressed -
5 Sobic.006G261400 peptidase, trypsin-like serine and cysteine proteases, putative, expressed -
6 Sobic.002G362800 formin-like protein 20, putative, expressed K02184: formin 2
7 Sobic.001G457900 expressed protein -
8 Sobic.007G051700 lissencephaly type-1-like homology motif, putative, expressed -
9 Sobic.001G111600 expressed protein -
10 Sobic.009G166100 PWWP domain containing protein, expressed -
11 Sobic.003G294600 Homeobox domain containing protein, expressed -
12 Sobic.001G170100 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed -
13 Sobic.001G426600 SH3 domain containing protein, expressed -
14 Sobic.001G051700 expressed protein -
15 Sobic.001G078100 expressed protein -
16 Sobic.003G293200 plus-3 domain containing protein, expressed -
17 Sobic.001G518400 EF hand family protein, putative, expressed -
18 Sobic.001G369000 adapitin protein, putative, expressed K12392: AP-1 complex subunit beta-1
19 Sobic.010G148932 - -
20 Sobic.007G019300 adaptin, putative, expressed K12397: AP-3 complex subunit beta


Gene co-expression network
sample Sobic001G384000 Sobic001G384000 Sobic005G200900 Sobic005G200900 Sobic001G384000--Sobic005G200900 Sobic001G196500 Sobic001G196500 Sobic001G384000--Sobic001G196500 Sobic006G138000 Sobic006G138000 Sobic001G384000--Sobic006G138000 Sobic007G168300 Sobic007G168300 Sobic001G384000--Sobic007G168300 Sobic006G261400 Sobic006G261400 Sobic001G384000--Sobic006G261400 Sobic002G362800 Sobic002G362800 Sobic001G384000--Sobic002G362800 Sobic001G457900 Sobic001G457900 Sobic001G384000--Sobic001G457900 Sobic007G051700 Sobic007G051700 Sobic001G384000--Sobic007G051700 Sobic001G111600 Sobic001G111600 Sobic001G384000--Sobic001G111600 Sobic004G355800 Sobic004G355800 Sobic005G200900--Sobic004G355800 Sobic002G154000 Sobic002G154000 Sobic005G200900--Sobic002G154000 Sobic003G360400 Sobic003G360400 Sobic005G200900--Sobic003G360400 Sobic009G251500 Sobic009G251500 Sobic005G200900--Sobic009G251500 Sobic009G088000 Sobic009G088000 Sobic005G200900--Sobic009G088000 Sobic006G118700 Sobic006G118700 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Octagon: transcription factors


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