Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G039800.1
Synonym EDM2
Functional annotation EDM2, putative, expressed
UniProt A0A1B6Q957
Pfam PF12047
Panther DB PTHR22884 PTHR22884:SF340
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G55390 : ENHANCED DOWNY MILDEW 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g24880.1 : EDM2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a016149
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G262100 expressed protein -
2 Sobic.008G063600 glycosyl hydrolase family protein 27, putative, expressed -
3 Sobic.002G052700 cyclophilin, putative, expressed K09566: peptidyl-prolyl isomerase G (cyclophilin G)
4 Sobic.003G435500 expressed protein -
5 Sobic.003G123100 expressed protein K03352: anaphase-promoting complex subunit 5
6 Sobic.010G188000 elongation factor, putative, expressed K12852: 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component
7 Sobic.004G038100 expressed protein K14303: NUP160, nuclear pore complex protein Nup160
8 Sobic.010G138900 cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region family protein, expressed K11991: tRNA(adenine34) deaminase
9 Sobic.001G397800 TOPBP1C - Similar to DNA replication protein TOPBP1 from, expressed K10728: topoisomerase (DNA) II binding protein 1
10 Sobic.007G047600 expressed protein -
11 Sobic.004G342300 expressed protein -
12 Sobic.001G248100 histone acetyltransferase GCN5, putative, expressed K06062: PCAF, KAT2, histone acetyltransferase
13 Sobic.004G177600 DDT domain containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.003G230600 transcription factor X1, putative, expressed -
15 Sobic.006G125500 expressed protein -
16 Sobic.001G300000 - -
17 Sobic.001G451300 NUP155, putative, expressed K14312: NUP155, NUP170, nuclear pore complex protein Nup155
18 Sobic.008G092800 expressed protein -
19 Sobic.008G080500 expressed protein -
20 Sobic.004G339700 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G039800 Sobic002G039800 Sobic010G262100 Sobic010G262100 Sobic002G039800--Sobic010G262100 Sobic008G063600 Sobic008G063600 Sobic002G039800--Sobic008G063600 Sobic002G052700 Sobic002G052700 Sobic002G039800--Sobic002G052700 Sobic003G435500 Sobic003G435500 Sobic002G039800--Sobic003G435500 Sobic003G123100 Sobic003G123100 Sobic002G039800--Sobic003G123100 Sobic010G188000 Sobic010G188000 Sobic002G039800--Sobic010G188000 Sobic004G038100 Sobic004G038100 Sobic002G039800--Sobic004G038100 Sobic010G138900 Sobic010G138900 Sobic002G039800--Sobic010G138900 Sobic001G397800 Sobic001G397800 Sobic002G039800--Sobic001G397800 Sobic001G451300 Sobic001G451300 Sobic010G262100--Sobic001G451300 Sobic010G262100--Sobic010G138900 Sobic001G248100 Sobic001G248100 Sobic010G262100--Sobic001G248100 Sobic008G080500 Sobic008G080500 Sobic010G262100--Sobic008G080500 Sobic002G043100 Sobic002G043100 Sobic010G262100--Sobic002G043100 Sobic002G399800 Sobic002G399800 Sobic010G262100--Sobic002G399800 Sobic002G371600 Sobic002G371600 Sobic010G262100--Sobic002G371600 Sobic003G314700 Sobic003G314700 Sobic010G262100--Sobic003G314700 Sobic008G092800 Sobic008G092800 Sobic010G262100--Sobic008G092800 Sobic001G027500 Sobic001G027500 Sobic008G063600--Sobic001G027500 Sobic002G168000 Sobic002G168000 Sobic008G063600--Sobic002G168000 Sobic009G012600 Sobic009G012600 Sobic008G063600--Sobic009G012600 Sobic003G396700 Sobic003G396700 Sobic008G063600--Sobic003G396700 Sobic009G045300 Sobic009G045300 Sobic008G063600--Sobic009G045300 Sobic003G188600 Sobic003G188600 Sobic008G063600--Sobic003G188600 Sobic003G129500 Sobic003G129500 Sobic008G063600--Sobic003G129500 Sobic008G045000 Sobic008G045000 Sobic008G063600--Sobic008G045000 Sobic009G188900 Sobic009G188900 Sobic008G063600--Sobic009G188900 Sobic001G251100 Sobic001G251100 Sobic002G052700--Sobic001G251100 Sobic004G357400 Sobic004G357400 Sobic002G052700--Sobic004G357400 Sobic003G042400 Sobic003G042400 Sobic002G052700--Sobic003G042400 Sobic004G321700 Sobic004G321700 Sobic002G052700--Sobic004G321700 Sobic001G393900 Sobic001G393900 Sobic002G052700--Sobic001G393900 Sobic001G003500 Sobic001G003500 Sobic002G052700--Sobic001G003500 Sobic001G052400 Sobic001G052400 Sobic002G052700--Sobic001G052400 Sobic003G379200 Sobic003G379200 Sobic002G052700--Sobic003G379200 Sobic008G147200 Sobic008G147200 Sobic002G052700--Sobic008G147200 Sobic001G385400 Sobic001G385400 Sobic003G435500--Sobic001G385400 Sobic003G435500--Sobic010G138900 Sobic001G143600 Sobic001G143600 Sobic003G435500--Sobic001G143600 Sobic002G127400 Sobic002G127400 Sobic003G435500--Sobic002G127400 Sobic006G173200 Sobic006G173200 Sobic003G435500--Sobic006G173200 Sobic003G144300 Sobic003G144300 Sobic003G435500--Sobic003G144300 Sobic003G435500--Sobic010G262100 Sobic003G435500--Sobic004G038100 Sobic002G143200 Sobic002G143200 Sobic003G435500--Sobic002G143200 Sobic007G014800 Sobic007G014800 Sobic003G123100--Sobic007G014800 Sobic006G236000 Sobic006G236000 Sobic003G123100--Sobic006G236000 Sobic009G142000 Sobic009G142000 Sobic003G123100--Sobic009G142000 Sobic003G123100--Sobic010G262100 Sobic001G239800 Sobic001G239800 Sobic003G123100--Sobic001G239800 Sobic003G123100--Sobic001G451300 Sobic002G252100 Sobic002G252100 Sobic003G123100--Sobic002G252100 Sobic005G010900 Sobic005G010900 Sobic003G123100--Sobic005G010900 Sobic006G112700 Sobic006G112700 Sobic003G123100--Sobic006G112700 Sobic001G373000 Sobic001G373000 Sobic010G188000--Sobic001G373000 Sobic010G188000--Sobic004G038100 Sobic010G188000--Sobic002G371600 Sobic006G181800 Sobic006G181800 Sobic010G188000--Sobic006G181800 Sobic010G188000--Sobic001G451300 Sobic002G160700 Sobic002G160700 Sobic010G188000--Sobic002G160700 Sobic004G315500 Sobic004G315500 Sobic010G188000--Sobic004G315500 Sobic010G188000--Sobic005G010900 Sobic010G236600 Sobic010G236600 Sobic010G188000--Sobic010G236600 Sobic006G033101 Sobic006G033101 Sobic004G038100--Sobic006G033101 Sobic004G038100--Sobic006G181800 Sobic004G038100--Sobic001G373000 Sobic004G215900 Sobic004G215900 Sobic004G038100--Sobic004G215900 Sobic004G038100--Sobic010G188000 Sobic003G259600 Sobic003G259600 Sobic004G038100--Sobic003G259600 Sobic001G373800 Sobic001G373800 Sobic004G038100--Sobic001G373800 Sobic006G280100 Sobic006G280100 Sobic004G038100--Sobic006G280100 Sobic009G104900 Sobic009G104900 Sobic004G038100--Sobic009G104900 Sobic008G088842 Sobic008G088842 Sobic010G138900--Sobic008G088842 Sobic010G138900--Sobic010G262100 Sobic010G138900--Sobic001G451300 Sobic010G138900--Sobic009G142000 Sobic001G453000 Sobic001G453000 Sobic010G138900--Sobic001G453000 Sobic010G138900--Sobic003G435500 Sobic003G250900 Sobic003G250900 Sobic010G138900--Sobic003G250900 Sobic004G034700 Sobic004G034700 Sobic010G138900--Sobic004G034700 Sobic010G138900--Sobic002G043100 Sobic006G242500 Sobic006G242500 Sobic001G397800--Sobic006G242500 Sobic001G397800--Sobic008G063600 Sobic001G300000 Sobic001G300000 Sobic001G397800--Sobic001G300000 Sobic002G204400 Sobic002G204400 Sobic001G397800--Sobic002G204400 Sobic001G397800--Sobic008G045000 Sobic001G397800--Sobic002G039800 Sobic003G423600 Sobic003G423600 Sobic001G397800--Sobic003G423600 Sobic004G307900 Sobic004G307900 Sobic001G397800--Sobic004G307900 Sobic001G541000 Sobic001G541000 Sobic001G397800--Sobic001G541000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.