Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G114000.1
Synonym BPC2, Sb02g009750, BBR/BPC2, ATBPC2
Functional annotation GAGA-binding protein, putative, expressed
UniProt C5X4B5
Pfam PF06217
Panther DB PTHR31421 PTHR31421:SF0
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G01930 : basic pentacysteine1
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g02584.1 : GAGA-binding protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a013327 , Zm00025a030380 , Zm00025a005221
Brachypodium -
Barley HORVU4Hr1G064660.4 , HORVU4Hr1G064660.5 , HORVU4Hr1G064660.6 , HORVU4Hr1G064660.7 , HORVU4Hr1G064660.1 , HORVU4Hr1G064660.2 , HORVU4Hr1G064660.3
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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19 Sobic.006G217200 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.005G028300 Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G114000 Sobic002G114000 Sobic006G088400 Sobic006G088400 Sobic002G114000--Sobic006G088400 Sobic004G033300 Sobic004G033300 Sobic002G114000--Sobic004G033300 Sobic010G012100 Sobic010G012100 Sobic002G114000--Sobic010G012100 Sobic009G053101 Sobic009G053101 Sobic002G114000--Sobic009G053101 Sobic001G179560 Sobic001G179560 Sobic002G114000--Sobic001G179560 Sobic008G041000 Sobic008G041000 Sobic002G114000--Sobic008G041000 Sobic003G002700 Sobic003G002700 Sobic002G114000--Sobic003G002700 Sobic008G056350 Sobic008G056350 Sobic002G114000--Sobic008G056350 Sobic006G215050 Sobic006G215050 Sobic002G114000--Sobic006G215050 Sobic006G088400--Sobic003G002700 Sobic002G416150 Sobic002G416150 Sobic006G088400--Sobic002G416150 Sobic002G429700 Sobic002G429700 Sobic006G088400--Sobic002G429700 Sobic006G088400--Sobic009G053101 Sobic003G075400 Sobic003G075400 Sobic006G088400--Sobic003G075400 Sobic007G101100 Sobic007G101100 Sobic006G088400--Sobic007G101100 Sobic010G257000 Sobic010G257000 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