Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G377800.1
Synonym Sb02g039490
Functional annotation heat shock protein DnaJ, putative, expressed
UniProt A0A1B6QFK2
Pfam -
Panther DB PTHR24078 PTHR24078:SF259
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G62970 : Chaperone DnaJ-domain superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g27460.2 : heat shock protein DnaJ, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a002741 , Zm00025a048779 , Zm00025a052104
Brachypodium PNT74736 , KQK15197
Barley HORVU2Hr1G030250.2
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G145100 SGT1 protein, putative, expressed -
2 Sobic.002G082100 serine/threonine-protein kinase, putative, expressed -
3 Sobic.002G052400 PPR repeat containing protein, expressed -
4 Sobic.009G105200 PPR repeat containing protein, expressed -
5 Sobic.008G022701 - K17710: pentatricopeptide repeat domain-containing protein 1
6 Sobic.010G138900 cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region family protein, expressed K11991: tRNA(adenine34) deaminase
7 Sobic.002G184400 Not investigated(PubMedID : 23766026)@ethylene-responsive transcription factor, putative, expressed K09286: EREBP-like factor
8 Sobic.001G544500 expressed protein -
9 Sobic.003G209400 expressed protein -
10 Sobic.007G059700 CRS2-associated factor 2, mitochondrial precursor, putative, expressed -
11 Sobic.010G153300 protein phosphatase 2C, putative, expressed K17679: ATP-dependent RNA helicase MSS116, mitochondrial
12 Sobic.005G100900 DAG protein, chloroplast precursor, putative, expressed -
13 Sobic.006G280100 SET domain containing protein, expressed -
14 Sobic.001G502600 tetratricopeptide repeat containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.001G144600 parafibromin, putative, expressed K15175: parafibromin
16 Sobic.010G228700 ATCPSF30/CPSF30, putative, expressed K14404: CPSF4, cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 4
17 Sobic.010G065800 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase domain containing protein, expressed K11855: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36/42
18 Sobic.001G261585 - -
19 Sobic.001G008000 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.008G088842 - -


Gene co-expression network
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Sobic002G356600 Sobic003G209400--Sobic002G356600
Octagon: transcription factors


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