Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G056500.1
Synonym emb2739, Sb05g004600
Functional annotation integrator complex subunit 3, putative, expressed
UniProt C5Y5Q9
Pfam PF10189
Panther DB PTHR13587
NCBI CDD -
KEGG Orthology K13140; integrator complex subunit 3
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G14590 : embryo defective 2739
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g07030.1 : integrator complex subunit 3, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a012861
Brachypodium KQJ89240
Barley HORVU4Hr1G019560.2 , HORVU4Hr1G019560.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G098100 cyclin, putative, expressed K06634: cyclin H
2 Sobic.010G038600 expressed protein -
3 Sobic.005G040500 OsFBX399 - F-box domain containing protein, expressed -
4 Sobic.008G038400 expressed protein -
5 Sobic.003G223300 chitinase domain-containing protein 1 precursor, putative, expressed K17525: chitinase domain-containing protein 1
6 Sobic.003G151200 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K13111: WD40 repeat-containing protein SMU1
7 Sobic.003G050700 - K12823: DDX5, ATP-dependent RNA helicase DDX5/DBP2
8 Sobic.004G330000 - K14807: DDX51, ATP-dependent RNA helicase DDX51/DBP6
9 Sobic.005G150600 expressed protein -
10 Sobic.004G172500 expressed protein -
11 Sobic.001G503200 ZOS3-01 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
12 Sobic.002G076500 protein Kinase-associated protein phosphatase, putative, expressed K01090: protein phosphatase
13 Sobic.006G138600 DIE2/ALG10 family, putative, expressed K03850: alpha-1,2-glucosyltransferase
14 Sobic.002G296400 E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, putative, expressed -
15 Sobic.003G310300 pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.010G244900 auxin efflux carrier, putative, expressed K17964: leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial
17 Sobic.008G116700 expressed protein -
18 Sobic.003G272700 transmembrane protein 16K, putative, expressed -
19 Sobic.004G344000 expressed protein -
20 Sobic.005G077800 OsFBX411 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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