Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G143300.3,Sobic.005G143300.4,Sobic.005G143300.1,Sobic.005G143300.2
Synonym Sb05g020850
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RIL1 , A0A1Z5RJI4 , A0A1Z5RIP0 , C5Y3V6
Pfam PF08766 PF09649 PF09649 PF08766 PF09649
Panther DB PTHR15410 PTHR15410:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G44780 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g34190.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a015719
Brachypodium KQJ88295 , KQJ88294 , KQJ88293
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.005G143300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G066400 MAR-binding filament-like protein 1, putative, expressed -
2 Sobic.002G060450 - -
3 Sobic.004G086200 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed K09566: peptidyl-prolyl isomerase G (cyclophilin G)
4 Sobic.006G210200 zinc finger domain, LSD1 subclass family protein, expressed -
5 Sobic.005G110523 - -
6 Sobic.002G380100 PPR repeat containing protein, expressed K17964: leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial
7 Sobic.002G050500 type I inositol-1,4,5-trisphosphate 5-phosphatase, putative, expressed -
8 Sobic.003G185250 - -
9 Sobic.004G239901 - -
10 Sobic.001G261521 - -
11 Sobic.001G090800 PHD finger family protein, putative, expressed -
12 Sobic.001G245900 expressed protein -
13 Sobic.009G151200 expressed protein -
14 Sobic.010G065300 expressed protein K11643: CHD4, chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4
15 Sobic.001G134300 - K17613: calcineurin-binding protein cabin-1
16 Sobic.001G511500 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K12837: splicing factor U2AF 65 kDa subunit
17 Sobic.001G454301 - -
18 Sobic.002G140800 RNA pseudouridine synthase, putative, expressed -
19 Sobic.007G029200 myosin heavy chain-related, putative, expressed -
20 Sobic.009G142000 plus-3 domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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