Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G026600.3,Sobic.010G026600.1,Sobic.010G026600.2
Synonym
Functional annotation B3 DNA binding domain containing protein, expressed
UniProt A0A194YGY6 , A0A194YHZ5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g42230.1 : B3 DNA binding domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a041429
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.010G026600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G047300 Trihelix Family(PubMedID : 24864043)@homeodomain, putative, expressed -
2 Sobic.006G080400 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase domain containing protein, expressed K11851: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30
3 Sobic.005G200900 SCC3, putative, expressed K06671: STAG1_2, SCC3, cohesin complex subunit SA-1/2
4 Sobic.002G048700 BT1 family protein, putative, expressed -
5 Sobic.008G002500 RCD1, putative, expressed -
6 Sobic.004G355800 expressed protein -
7 Sobic.010G038100 OsFBDUF30 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
8 Sobic.004G155600 dnaJ domain containing protein, expressed -
9 Sobic.009G088000 expressed protein -
10 Sobic.004G266900 AAA-type ATPase family protein, putative, expressed K17681: ATPase family AAA domain-containing protein 3A/B
11 Sobic.009G095100 expressed protein -
12 Sobic.003G360400 ulp1 protease family protein, putative, expressed K08596: sentrin-specific protease 7
13 Sobic.006G261400 peptidase, trypsin-like serine and cysteine proteases, putative, expressed -
14 Sobic.003G428100 FYVE zinc finger domain containing protein, expressed -
15 Sobic.006G118700 MYB family transcription factor, putative, expressed -
16 Sobic.006G040800 expressed protein -
17 Sobic.001G354600 SAP domain containing protein, expressed K12875: ACIN1, apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus
18 Sobic.006G240100 BRCA1-associated protein, putative, expressed K10632: BRCA1-associated protein
19 Sobic.001G025000 FACT complex subunit SPT16, putative, expressed -
20 Sobic.008G080500 expressed protein -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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