Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G179700.1,Sobic.010G179700.3,Sobic.010G179700.2
Synonym Sb10g023130
Functional annotation enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein, putative, expressed
UniProt A0A194YL01 , A0A194YJZ8 , A0A194YK00
Pfam PF00378
Panther DB PTHR11941 PTHR11941:SF47
NCBI CDD KOG1684; Enoyl-CoA hydratase
KEGG Orthology K05605; 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase
Gene Ontology GO:0008152; metabolic process GO:0003824catalytic activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G13360 : ATP-dependent caseinolytic (Clp) protease/crotonase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g39344.2,LOC_Os06g39344.1 : enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a051243
Brachypodium KQK17833
Barley HORVU7Hr1G085310.10 , HORVU7Hr1G085310.11 , HORVU7Hr1G085310.6 , HORVU7Hr1G085310.7 , HORVU7Hr1G085310.4 , HORVU7Hr1G085310.5 , HORVU7Hr1G085310.2 , HORVU7Hr1G085310.3 , HORVU7Hr1G085310.1 , HORVU7Hr1G085310.8 , HORVU7Hr1G085310.9
Wheat TraesCS7B02G257500 , TraesCS7B02G257500 , TraesCS7A02G370500 , TraesCS7A02G370500 , TraesCS7A02G370500 , TraesCS7D02G352500 , TraesCS7D02G352500 , TraesCS7A02G370500 , TraesCS7D02G352500
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cDNA sequences
Sobic.010G179700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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18 Sobic.001G211900 methyltransferase, putative, expressed K11437: type I protein arginine methyltransferase
19 Sobic.007G047600 expressed protein -
20 Sobic.001G115700 2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain containing protein, expressed K03934: NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 1


Gene co-expression network
sample Sobic010G179700 Sobic010G179700 Sobic003G165101 Sobic003G165101 Sobic010G179700--Sobic003G165101 Sobic001G467100 Sobic001G467100 Sobic010G179700--Sobic001G467100 Sobic004G208500 Sobic004G208500 Sobic010G179700--Sobic004G208500 Sobic003G395300 Sobic003G395300 Sobic010G179700--Sobic003G395300 Sobic002G144275 Sobic002G144275 Sobic010G179700--Sobic002G144275 Sobic001G004200 Sobic001G004200 Sobic010G179700--Sobic001G004200 Sobic008G072200 Sobic008G072200 Sobic010G179700--Sobic008G072200 Sobic004G075200 Sobic004G075200 Sobic010G179700--Sobic004G075200 Sobic005G163700 Sobic005G163700 Sobic010G179700--Sobic005G163700 Sobic004G275600 Sobic004G275600 Sobic003G165101--Sobic004G275600 Sobic003G165101--Sobic010G179700 Sobic004G283600 Sobic004G283600 Sobic003G165101--Sobic004G283600 Sobic006G010400 Sobic006G010400 Sobic003G165101--Sobic006G010400 Sobic001G428800 Sobic001G428800 Sobic003G165101--Sobic001G428800 Sobic007G161200 Sobic007G161200 Sobic003G165101--Sobic007G161200 Sobic006G237000 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Octagon: transcription factors


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