Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G075800.3,Sobic.003G075800.2,Sobic.003G075800.1
Synonym Sb03g006380
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6Q1X6 , C5XQ36 , A0A1B6Q1V9
Pfam -
Panther DB PTHR34360 PTHR34360:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g20380.4,LOC_Os02g20380.1,LOC_Os02g20380.2 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a035606
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G075800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G093500 ribosomal protein S7, putative, expressed K13173: arginine and glutamate-rich protein 1
2 Sobic.002G399200 - K14779: DDX52, ATP-dependent RNA helicase DDX52/ROK1
3 Sobic.001G507900 methyltransferase, putative, expressed K00599: methyltransferase-like protein 6
4 Sobic.009G235200 ribosomal RNA large subunit methyltransferase J, putative, expressed K14857: SPB1, AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1
5 Sobic.002G428100 tim44-like domain containing protein, expressed K17804: mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44
6 Sobic.010G141500 ulp1 protease family protein, putative, expressed K16287: ubiquitin-like-specific protease 1C/D
7 Sobic.009G040500 glioma tumor suppressor candidate region gene 2 protein, putative, expressed K14840: NOP53, nucleolar protein 53
8 Sobic.001G261585 - -
9 Sobic.007G126500 - K14808: DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54/DBP10
10 Sobic.007G039300 ATP-binding region, ATPase-like domain containing protein, expressed -
11 Sobic.002G076800 expressed protein -
12 Sobic.001G542300 expressed protein -
13 Sobic.006G207200 glycosyl hydrolase family 47 domain contain protein, expressed K01230: MAN1A_C, mannosyl-oligosaccharide alpha-1,2-mannosidase
14 Sobic.004G211100 RNA binding protein, putative, expressed K11090: LA, lupus La protein
15 Sobic.001G465300 splicing factor, putative, expressed -
16 Sobic.001G029400 RNA-binding motif protein, putative, expressed K13107: RBMX2, RNA-binding motif protein, X-linked 2
17 Sobic.001G424600 digalactosyldiacylglycerol synthase, chloroplast precursor, putative, expressed K09480: digalactosyldiacylglycerol synthase
18 Sobic.004G137500 expressed protein -
19 Sobic.010G042700 expressed protein -
20 Sobic.001G537800 SNF7 domain containing protein, putative, expressed K12193: VPS24, charged multivesicular body protein 3


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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