Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G144300.1
Synonym Sb03g012490
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XI62
Pfam PF14648 PF14647
Panther DB PTHR28441 PTHR28441:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G35220 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g19760.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a024292 , Zm00025a024293
Brachypodium PNT70416 , KQK04081 , KQK04082
Barley HORVU1Hr1G059750.1 , HORVU1Hr1G059750.3 , HORVU1Hr1G059750.5 , HORVU1Hr1G059750.4 , HORVU1Hr1G059750.7 , HORVU1Hr1G059750.6 , HORVU1Hr1G059750.9 , HORVU1Hr1G059750.8 , HORVU1Hr1G059750.11 , HORVU1Hr1G059750.10 , HORVU1Hr1G059750.12 , HORVU3Hr1G046180.4 , HORVU3Hr1G046180.5 , HORVU3Hr1G046180.2 , HORVU3Hr1G046180.3 , HORVU3Hr1G046180.1
Wheat TraesCS1B02G238700 , TraesCS1D02G226700 , TraesCS3D02G201000 , TraesCS1A02G225300 , TraesCS3B02G232100 , TraesCS3A02G199300
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G256500 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K12616: enhancer of mRNA-decapping protein 4
2 Sobic.003G294600 Homeobox domain containing protein, expressed -
3 Sobic.002G327000 villin protein, putative, expressed -
4 Sobic.002G179400 DNA binding protein, putative, expressed -
5 Sobic.007G168300 UDP-N-acetylglucosamine--peptide N-acetylglucosaminyltransferase SPINDLY, putative, expressed -
6 Sobic.008G124800 expressed protein -
7 Sobic.007G019300 adaptin, putative, expressed K12397: AP-3 complex subunit beta
8 Sobic.004G085000 expressed protein K14310: NUP205, nuclear pore complex protein Nup205
9 Sobic.001G453000 no apical meristem protein, putative, expressed -
10 Sobic.003G435500 expressed protein -
11 Sobic.002G068100 aminoacyl-tRNA synthetase, putative, expressed -
12 Sobic.007G077900 zinc finger domain, LSD1 subclass family protein, expressed -
13 Sobic.003G233400 expressed protein -
14 Sobic.001G051700 expressed protein -
15 Sobic.010G114900 expressed protein -
16 Sobic.001G457900 expressed protein -
17 Sobic.003G314700 expressed protein -
18 Sobic.001G137000 aberrant pollen transmission 1, putative, expressed -
19 Sobic.004G147500 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed K09667: protein O-GlcNAc transferase
20 Sobic.003G312100 guanine nucleotide exchange family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G144300 Sobic003G144300 Sobic004G256500 Sobic004G256500 Sobic003G144300--Sobic004G256500 Sobic003G294600 Sobic003G294600 Sobic003G144300--Sobic003G294600 Sobic002G327000 Sobic002G327000 Sobic003G144300--Sobic002G327000 Sobic002G179400 Sobic002G179400 Sobic003G144300--Sobic002G179400 Sobic007G168300 Sobic007G168300 Sobic003G144300--Sobic007G168300 Sobic008G124800 Sobic008G124800 Sobic003G144300--Sobic008G124800 Sobic007G019300 Sobic007G019300 Sobic003G144300--Sobic007G019300 Sobic004G085000 Sobic004G085000 Sobic003G144300--Sobic004G085000 Sobic001G453000 Sobic001G453000 Sobic003G144300--Sobic001G453000 Sobic004G131300 Sobic004G131300 Sobic004G256500--Sobic004G131300 Sobic009G234700 Sobic009G234700 Sobic004G256500--Sobic009G234700 Sobic001G145400 Sobic001G145400 Sobic004G256500--Sobic001G145400 Sobic002G133300 Sobic002G133300 Sobic004G256500--Sobic002G133300 Sobic002G142900 Sobic002G142900 Sobic004G256500--Sobic002G142900 Sobic004G053500 Sobic004G053500 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Octagon: transcription factors


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